Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03238
- Subject:
- NM_023320.2
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 1086
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT 74
||||||||||.|...||||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||.||||..|||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGAAGAAGAGCGGCTCCGGCAAGCGGGGGCCTCCGGATGGAAACCATCAGTCTGCGGCGCCCGAGAAGGT 71
Query 75 CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG 145
Query 149 GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC 222
|.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 146 GCGACCAGCTCTACGTCTCCGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAACAGTCAGGAGGTGTTTGACCTGAGTGAC 219
Query 223 TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA 296
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.
Sbjct 220 TATGAGAAGTGCGAAGAGCTCCGGAAATCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCACAGCAAGTTCACCCTGGCCCG 293
Query 297 CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA 370
.|.||.||||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 294 GTGCAGACAGCCGGGCACCACGGCACCCAACCTCATCTTCCTGGCCGTGAGTCCTGAAGAGAAGGAGTCATGGA 367
Query 371 TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC 444
||||.|||||.|..||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TCAACGCCCTGAGTTCTGCCATTACCAGAGCTAAAAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC 441
Query 445 TATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGACACCTAAT 518
|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 442 TATCTTGCCCACCCTACTCGAGACAGAGCAAAAATCCAACACTCCCGCCGTCCTCCAACCCGGGGACACCTCAT 515
Query 519 GGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG 592
||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 GGCTGTGGCTTCGACCTCTACCTCAGATGGGATGCTAACATTAGACCTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG 589
Query 593 AGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGGGAGCCGG 666
||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 590 AGGAGCCAGCCTCTTGTGCTGAGAGCTTCCGGGTCGATCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCTGGCAGTCGA 663
Query 667 CGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTC--CGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGGAAAAA 738
||||||||||||||||||.|.||||||||||| ||||| |||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 664 CGGAGAGCGGACTCAGACAGGATCCAGCCCTCTTCGCAG--CGGGCAAGCAGCCTTTCTCGGCCTTGGGAAAAA 735
Query 739 ACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCC----ACAGAGAAAGGCCGCTGCG 808
.|||||||.||.|||.||||||||||.||.||||..|||||||| ||| ||||||||..||||.||.|
Sbjct 736 CCAGACAAGGGAGCCCCCTACACCCCACAAGCACTGAAGAAGTT----CCCCAGTACAGAGAAGAGCCGATGTG 805
Query 809 CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACCC 882
||||||||||||||||||||||.|||.||||..|||||.|.||||||.||||.||.||.|..|||||||||.||
Sbjct 806 CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCCCAGAGGGACACTGCCCCAGCCCGCCCCCTTCACCTTCAAGCTGAGGAATCC 879
Query 883 CCAACCCCTG-CCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA 955
|.|.|||||| ||||.||| |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 880 CTACCCCCTGTCCCTGCCC-AGCCAGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGAAGA 952
Query 956 CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG 1029
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||.
Sbjct 953 CTCAGGAGCTGCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGTGACGGCAAGCGGAAGGCCAAGGACCCCCCACAGTCTCCA 1026
Query 1030 CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA 1103
||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1027 CCCGACTCGGAGTCGGAGCAGCTGCTGCTGGAGACAGAGAGGCTGCTGGGAGAGGCTTCCTCCAACTGGAGCCA 1100
Query 1104 GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 1177
|||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 GGCAAAGAGAGTGCTGCAGGAAGTCCGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGGCAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 1174
Query 1178 CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG 1227
|||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CCCACCTCAGACAGACCTCCCAGCACAGTCAATACCGGAAGAGCCTGATG 1224