Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03238
- Subject:
- XM_024447478.1
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 818
- Gaps:
- 413
Alignment
Query 1 ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGA---ACCGTA----TCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGA 437
|.|| ||.||| ||| |.||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------ATGATTCACAGTACATCTCT----TCAGGTCACCGTTGAGGA 38
Query 438 GGACAGCTATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGAC 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 GGACAGCTATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGAC 112
Query 512 ACCTAATGGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCT 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 ACCTAATGGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCT 186
Query 586 TCCCCTGAGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 TCCCCTGAGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGG 260
Query 660 GAGCCGGCGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTCCGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGG 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GAGCCGGCGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTCCGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGG 334
Query 734 AAAAAACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCCACAGAGAAAGGCCGCTGC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 AAAAAACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCCACAGAGAAAGGCCGCTGC 408
Query 808 GCCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACC 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GCCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACC 482
Query 882 CCCAACCCCTGCCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CCCAACCCCTGCCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA 556
Query 956 CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG 630
Query 1030 CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA 704
Query 1104 GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT 778
Query 1178 CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG 828