Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03282
• Subject: XM_011239378.2
• Aligned Length: 2061
• Identities: 1668
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCTCAAATGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCCCAAATGAA  74

Query   75  GCAGGATCCA---------------------CAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCA  127
            ||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGATCCACAGATATTTTTTCTTTCCAATCAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCA  148

Query  128  AAATCACAGCTTTGAGTGAGAAACAGAAAAGAGTAGTTGAACAGCTACGGAAGAACCTGATAGTAAAGCAAGAA  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  AAATCACAGCTTTGAGTGAGAAACAGAAAAGAGTAGTTGAGCAGCTGCGCAAGAACCTGATAGTCAAACAAGAG  222

Query  202  CAACCGGACAAGTTCCAAATACAGCCATTGCCACAATCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAACCACT  275
            ||.||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CAGCCGGACAAGTTCCAGATACAGCCATTGTCACAGTCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAGCCACT  296

Query  276  ACAGCAACTACAACAACAGCAGCAGTACCACCACCACCACGCCCAGCAGTCAGCTGCAGCCTCTCCCAACCTGA  349
            |||||.|||         |||||||.|.||.|..||.||..|.|||||| ||||.||||               
Sbjct  297  ACAGCCACT---------GCAGCAGCAGCAACCGCAGCAACCGCAGCAG-CAGCAGCAG---------------  345

Query  350  CTGCTTCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCAGCA  423
                    |||             ||||                                       |||||||
Sbjct  346  --------CAG-------------CAGC---------------------------------------AGCAGCA  359

Query  424  ACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTGGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGTCAGAA  497
                                                                    ||||  ||.|||||||.|
Sbjct  360  --------------------------------------------------------CGCC--CAGCAGTCAGCA  375

Query  498  GGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTGGGG  571
            |        ||||||                                ||.|||||   .|.||||         
Sbjct  376  G--------CAGCAC--------------------------------CGCCTAGT---CTAACTG---------  397

Query  572  CAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCTGGTTCAGGCAACACCTCCTCAGCCCATCAAAGTA  645
                                     .|.||||        ||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  -------------------------CATCACA--------GGTTCAAGCAACACCTCCTCAGCCCATCAAAGTA  438

Query  646  CCACAGTTTATCCCCCCTCCTAGACTCACTCCACGTCCAAACTTTCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCCTGTGGC  719
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CCACAGTTTATCCCTCCTCCTAGACTCACTCCACGCCCAAACTTCCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCCTGTGGC  512

Query  720  CCAGAATAACATTCCTATTGCCCCAGCACCACCTCCCATGCTCGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGCCCGTCA  793
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  513  CCAGAATAACATTCCTATCGCTCCAGCGCCTCCTCCCATGCTTGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGCCTGTCA  586

Query  794  TGCTGACCAAGTTCACCCCCACAACCCTTCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCCGTCCGTGTCGTCAATGGG  867
            |||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  587  TGCTGACCAAGTTTACACCCACAACCCTCCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCTGTCCGTGTTGTCAATGGA  660

Query  868  CAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTGATAGCTACTCCAGGGACCAG  941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTCATAGCTACTCCAGGGACCAG  734

Query  942  ACTCGCTGGACCTCAAACTGTACAGCTTAGCAAGCCAAGTCTTGAAAAACAGACAGTTAAATCTCACACAGAAA  1015
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|||||.
Sbjct  735  ACTCCCTGGACCTCAGACTGTACAGCTTAGCAAACCAAGCCTGGAGAAACAGACAGTTAAATCCCACCCAGAAG  808

Query 1016  CAGATGAGAAACAAACAGAGAGCCGCACCATCACCCCACCTGCTGCACCCAAACCAAAACGGGAGGAGAACCCT  1089
            ||||.||.||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  809  CAGAGGAAAAACAAGCAGAGAGCCGTACCGTTACCCCACCTGCTGCACCAAAACCAAAACGAGAAGAGAACCCT  882

Query 1090  CAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAAGAGGCA  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAAGAGGCA  956

Query 1164  AGAGCGAAAAAGAAGAACAACAGCAAATCCGGTCTACAGTGGAGCAGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGAAGAGTG  1237
            .||..||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GGAAAGAAAGAGAAGAACAACAGCAAACCCGGTGTACAGTGGGGCTGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGAAGAGTG  1030

Query 1238  CAGTGACATACCTAAACAGCACAATGCACCCTGGGACCCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAATGCAGTG  1311
            ||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1031  CAGTCACTTACCTTAACAGCACAATGCATCCTGGGACGCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAATGCGGTG  1104

Query 1312  CTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCAATCCAGTCATCCTGACTCCCCTGAAAATGAAAAGACAGA  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  CTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCCATCCAGTCATCCCGACTCCCCTGAAAATGAAAAGACAGA  1178

Query 1386  GACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCCCTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTGATATTC  1459
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1179  GACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCTTTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTGATATCC  1252

Query 1460  ATGAGGATTTTTGCAGCGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTACTGATGTGCGACACATGTTCCCGTGTATATCAT  1533
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1253  ATGAGGATTTTTGCAGTGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTGCTGATGTGTGACACGTGTTCCCGTGTGTATCAT  1326

Query 1534  TTGGACTGCTTAGACCCCCCTCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGACCAGAT  1607
            .|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  CTGGACTGCTTAGAGCCGCCCCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGACCAGAT  1400

Query 1608  GCTGAAGAAGGAAGAAGCAATTCCATGGCCTGGAACTTTAGCAATTGTTCATTCCTATATTGCCTACAAAGCAG  1681
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1401  GCTAAAGAAGGAAGAAGCAATTCCTTGGCCTGGAACCTTAGCCATTGTTCATTCCTACATCGCCTACAAAGCAG  1474

Query 1682  CAAAAGAAGAAGAGAAACAGAAGTTACTTAAATGGAGTTCAGATTTAAAACAAGAACGAGAACAACTAGAGCAA  1755
            ||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1475  CAAAAGAAGAGGAGAAACAGAAGCTACTTAAGTGGAGTTCAGATTTAAAACAGGAGCGGGAACAACTGGAGCAG  1548

Query 1756  AAGGTGAAACAGCTCAGCAATTCCATAAGTAAATGCATGGAAATGAAGAACACCATCCTGGCCCGGCAGAAGGA  1829
            |||||.|||.|||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||||.||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1549  AAGGTCAAAGAGCTCAGCAGTTCTATAAGTAAATGTATGGAGATGAAGAGCAGCATCCTGGCGCGGCAGAAGGA  1622

Query 1830  GATGCACAGCTCCCTGGAGAAGGTAAAACAGCTGATTCGCCTCATCCACGGCATCGACCTCTCCAAACCTGTAG  1903
            |||||.||||||||||||.|||||.||.|.|||.||.|||||..|.||.|||.|||||||||.||.||||||.|
Sbjct 1623  GATGCGCAGCTCCCTGGACAAGGTGAAGCGGCTCATCCGCCTTGTGCATGGCGTCGACCTCTGCAGACCTGTGG  1696

Query 1904  ACTCTGAGGCCACTGTGGGGGCCATCTCCAATGGCCCGGACTGCACCCCCCCTGCCAATGCCGCCACCTCCACG  1977
            ||||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||   ||||.|||||||.
Sbjct 1697  ACTCAGAGGCCACGGCGGGGGCCCTCTCCAATGGCCCAGACTGCACTCCCCCTGCCAA---CGCCGCCTCCACA  1767

Query 1978  CCGGCCCCTTCCCCCTCCTCCCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  2040
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  CCCGCCCCTTCCCCCTCCTCGCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  1830