Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03282
• Subject: XM_017316527.1
• Aligned Length: 2067
• Identities: 1894
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCTCAAATGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCCCAAATGAA  74

Query   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148

Query  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAACAGCTACGGAAGAACCTGATAGTAAAGCAAGAACAACCGGACAAGTTCCAAATA  222
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAGCAGCTGCGCAAGAACCTGATAGTCAAACAAGAGCAGCCGGACAAGTTCCAGATA  222

Query  223  CAGCCATTGCCACAATCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAACCACTA--------------------  276
            |||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||                    
Sbjct  223  CAGCCATTGTCACAGTCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAGCCACTACAGCCACTGCAGCAGCAGCA  296

Query  277  ----CAGCAACTACAACAACAGCAGCAGTACCACCACCACCACGCCCAGCAGTCAGCTGCAGCCTCTCCCAACC  346
                |||||||..||.||.|||||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.||.|..|
Sbjct  297  ACCGCAGCAACCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGCCCAGCAGTCAGCAGCAGCACCGCCTAGTC  370

Query  347  TGACTGCTTCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  420
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAACTGCATCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  444

Query  421  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTGGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGTCA  494
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTTGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGCCA  518

Query  495  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  592

Query  569  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCT---GGTTCAGGCAACACCTCCTCAGCCCATC  639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCTGCAGGTTCAAGCAACACCTCCTCAGCCCATC  666

Query  640  AAAGTACCACAGTTTATCCCCCCTCCTAGACTCACTCCACGTCCAAACTTTCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  713
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTACCACAGTTTATCCCTCCTCCTAGACTCACTCCACGCCCAAACTTCCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  740

Query  714  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATTGCCCCAGCACCACCTCCCATGCTCGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  787
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATCGCTCCAGCGCCTCCTCCCATGCTTGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  814

Query  788  CCGTCATGCTGACCAAGTTCACCCCCACAACCCTTCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCCGTCCGTGTCGTC  861
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  CTGTCATGCTGACCAAGTTTACACCCACAACCCTCCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCTGTCCGTGTTGTC  888

Query  862  AATGGGCAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTGATAGCTACTCCAGG  935
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  AATGGACAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTCATAGCTACTCCAGG  962

Query  936  GACCAGACTCGCTGGACCTCAAACTGTACAGCTTAGCAAGCCAAGTCTTGAAAAACAGACAGTTAAATCTCACA  1009
            ||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct  963  GACCAGACTCCCTGGACCTCAGACTGTACAGCTTAGCAAACCAAGCCTGGAGAAACAGACAGTTAAATCCCACC  1036

Query 1010  CAGAAACAGATGAGAAACAAACAGAGAGCCGCACCATCACCCCACCTGCTGCACCCAAACCAAAACGGGAGGAG  1083
            |||||.||||.||.||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  CAGAAGCAGAGGAAAAACAAGCAGAGAGCCGTACCGTTACCCCACCTGCTGCACCAAAACCAAAACGAGAAGAG  1110

Query 1084  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1184

Query 1158  GAGGCAAGAGCGAAAAAGAAGAACAACAGCAAATCCGGTCTACAGTGGAGCAGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1231
            ||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGCAGGAAAGAAAGAGAAGAACAACAGCAAACCCGGTGTACAGTGGGGCTGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1258

Query 1232  AGAGTGCAGTGACATACCTAAACAGCACAATGCACCCTGGGACCCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAAT  1305
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAGTGCAGTCACTTACCTTAACAGCACAATGCATCCTGGGACGCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAAT  1332

Query 1306  GCAGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCAATCCAGTCATCCTGACTCCCCTGAAAATGAAAA  1379
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCGGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCCATCCAGTCATCCCGACTCCCCTGAAAATGAAAA  1406

Query 1380  GACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCCCTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTG  1453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCTTTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTG  1480

Query 1454  ATATTCATGAGGATTTTTGCAGCGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTACTGATGTGCGACACATGTTCCCGTGTA  1527
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  ATATCCATGAGGATTTTTGCAGTGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTGCTGATGTGTGACACGTGTTCCCGTGTG  1554

Query 1528  TATCATTTGGACTGCTTAGACCCCCCTCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1601
            ||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATCATCTGGACTGCTTAGAGCCGCCCCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1628

Query 1602  CCAGATGCTGAAGAAGGAAGAAGCAATTCCATGGCCTGGAACTTTAGCAATTGTTCATTCCTATATTGCCTACA  1675
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  CCAGATGCTAAAGAAGGAAGAAGCAATTCCTTGGCCTGGAACCTTAGCCATTGTTCATTCCTACATCGCCTACA  1702

Query 1676  AAGCAGCAAAAGAAGAAGAGAAACAGAAGTTACTTAAATGGAGTTCAGATTTAAAACAAGAACGAGAACAACTA  1749
            ||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1703  AAGCAGCAAAAGAAGAGGAGAAACAGAAGCTACTTAAGTGGAGTTCAGATTTAAAACAGGAGCGGGAACAACTG  1776

Query 1750  GAGCAAAAGGTGAAACAGCTCAGCAATTCCATAAGTAAATGCATGGAAATGAAGAACACCATCCTGGCCCGGCA  1823
            |||||.|||||.|||.|||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||||.||.|||||||||.|||||
Sbjct 1777  GAGCAGAAGGTCAAAGAGCTCAGCAGTTCTATAAGTAAATGTATGGAGATGAAGAGCAGCATCCTGGCGCGGCA  1850

Query 1824  GAAGGAGATGCACAGCTCCCTGGAGAAGGTAAAACAGCTGATTCGCCTCATCCACGGCATCGACCTCTCCAAAC  1897
            |||||||||||.||||||||||||.|||||.||.|.|||.||.|||||..|.||.|||.|||||||||.||.||
Sbjct 1851  GAAGGAGATGCGCAGCTCCCTGGACAAGGTGAAGCGGCTCATCCGCCTTGTGCATGGCGTCGACCTCTGCAGAC  1924

Query 1898  CTGTAGACTCTGAGGCCACTGTGGGGGCCATCTCCAATGGCCCGGACTGCACCCCCCCTGCCAATGCCGCCACC  1971
            ||||.|||||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||   ||||.||
Sbjct 1925  CTGTGGACTCAGAGGCCACGGCGGGGGCCCTCTCCAATGGCCCAGACTGCACTCCCCCTGCCAA---CGCCGCC  1995

Query 1972  TCCACGCCGGCCCCTTCCCCCTCCTCCCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  2040
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  TCCACACCCGCCCCTTCCCCCTCCTCGCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  2064