Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03289
• Subject: XM_017016320.1
• Aligned Length: 1685
• Identities: 1524
• Gaps: 157

Alignment

Query    1  ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACACAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACACAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGG  74

Query   75  GGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGTGCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGTGCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTA  148

Query  149  AGCAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAACTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAACTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTC  222

Query  223  AAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTTTTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTTTTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTC  296

Query  297  TGGGGCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCCCAGCAACCCCAGCTTGATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGGCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCCCAGCAACCCCAGCTTGATGG  370

Query  371  ACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGCATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGCATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGAC  444

Query  445  TATCCAAGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGACCAGACAGCTCCCAGACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCCAAGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGACCAGACAGCTCCCAGACTT  518

Query  519  AGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCATATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCATATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGCC  592

Query  593  CCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCTCACCAACTCCTACGTGCTCTACTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCTCACCAACTCCTACGTGCTCTACTCC  666

Query  667  AAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACGCCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACGCCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCA  740

Query  741  CTTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTGCGGGACCACAGACCTCTATGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTGCGGGACCACAGACCTCTATGACC  814

Query  815  GCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGTTCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGTTCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTGGA  888

Query  889  ATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGAAGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGAAGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGC  962

Query  963  ACACCAGATCCATCAAGGACTGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATCGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACACCAGATCCATCAAGGACTGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATCGGGG  1036

Query 1037  AGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTGGACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTGGACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCA  1110

Query 1111  CCGTTTCTGACGCAGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTCAGGGACCCTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGTTTCTGACGCAGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTCAGGGACCCTGT  1184

Query 1185  GGAGAGGTTGTACTCAGACTATCTCTACTTTGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGAGGTTGTACTCAGACTATCTCTACTTTGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGA  1258

Query 1259  CAGAAGCACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGCGTCTACAACAACACCCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAAGCACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGCGTCTACAACAACACCCTC  1332

Query 1333  AACAACGCCATGCCTGTGAGGCTCCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACAACGCCATGCCTGTGAGGCTCCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTGA  1406

Query 1407  CAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTCAAGTACACCATGCACAAGGTCTTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTCAAGTACACCATGCACAAGGTCTTCC  1480

Query 1481  AGTTTCTGAACCTAGGGCC-CTTAAGTGAGAAGCAGGAGGCTTTGATGACCAAGAGCCCCGCA-TCCAATGCAC  1552
            ||||||||||||||||||| ||                                    ||.|| ||||      
Sbjct 1481  AGTTTCTGAACCTAGGGCCTCT------------------------------------CCTCACTCCA------  1512

Query 1553  GGCGTCCCGAGGACCGGAACCTGGGGCCCATGTGGCCCATCACACAGAAGATTCTGCGGGATTTCTACAGGCCC  1626
                    ||||.|        |||||    |||||..                                    
Sbjct 1513  --------GAGGGC--------GGGGC----GTGGCGG------------------------------------  1530

Query 1627  TTCAACGCTAGGCTGGCGCAGGTCCTCGCGGATGAGGCGTTTGCGTGGAAGACGACG  1683
                                                                     
Sbjct 1531  ---------------------------------------------------------  1530