Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03298
• Subject: NM_025446.4
• Aligned Length: 793
• Identities: 633
• Gaps: 86

Alignment

Query   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGGTAGCAATCCTGCTATCCTATTGCTCCATCCTGTGCAACTACAA  74

Query  75  GGCCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCTGGTTATCC  148
           ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  75  GGCCATCGAAATGCCCTCGCATCAGACCTACGGAGGCAGCTGGAAGTTCCTGACCTTCATTGATCTGGTTATCC  148

Query 149  AGGCTGTCTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAG  222
           ||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||..||||.||.||||||||||||
Sbjct 149  AGGCCGTGTTCTTCGGCATCTGTGTGCTGACTGACCTCTCTAGTCTTCTGACCAGAGGCAGCGGGAACCAGGAG  222

Query 223  CAAGAGAGGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGT  296
           |||||..|.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct 223  CAAGAACGACAGCTCAGGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGACGCTGGCCGTGCTGGCCTTCCCTGTCGGGGT  296

Query 297  TTTTGTTGTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAG-CTGCTGGATAAT  369
           |||||||||.||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| .||||.||.||.
Sbjct 297  TTTTGTTGTTGCGGTGTTCTGGACCATCTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCC-AAGATTGCTTGACAAC  369

Query 370  TTTATCCCAGGGTGGCTGAATCACGGAATGCACACGACGGTTCTGCCCTTTATATTAATCGAGATGAGGACATC  443
           ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 370  TTTATCCCAGGGTGGCTGAACCATGGAATGCACACAACGGTTTTGCCCTTTATATTGATCGAGATGAGAACATC  443

Query 444  GCACCATCAGTATCCCAGCAGGAGCAGCGGACTTACCGCCATATGTACCTTCTCTGTTGGCTATATATTATGGG  517
           .||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 444  CCACCATCAGTATCCCAGCAGGAGCAGTGGACTCGCCGCCATATGCACCTTCTCCGTGGGCTATATATTATGGG  517

Query 518  TGTGCTGGGTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATC  591
           ||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||
Sbjct 518  TGTGCTGGATACATCATGTCACCGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACATATTGGCTCAGGAGCCAGGATC  591

Query 592  ATCTTCTTTGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTG  665
           ||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||
Sbjct 592  ATCTTCTTTGGGTCAACAACCATCCTAATGAATTTCCTGTACCTGCTTGGAGAAGTACTAAACAGCTATATCTG  665

Query 666  GGATACACAGAAAAGTATGGAAG-------------AAGAGA-------------AAG-------AAAAGCCT-  705
           |||||||||||.||    ..|||             ||||.|             |||       |||  ||| 
Sbjct 666  GGATACACAGAGAA----CAAAGGCTCCTTCTTGTCAAGACACCCAATCTTCTCTAAGCTGTGCCAAA--CCTG  733

Query 706  ----AAAT---TGGAA-------------------------------------  714
               ||||   ||.||                                     
Sbjct 734  TCCAAAATCTATGTAAAGATACATTCATGCTGGAAGGTGGGAAGGCGAGAGCT  786