Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03317
Subject:
NM_001291286.1
Aligned Length:
591
Identities:
493
Gaps:
60

Alignment

Query   1  ATGTTTGGCTGCTTGGTGGCGGGGAGGCTGGTGCAAACAGCTGCACAGCAAGTGGCAGAGGATAAATTTGTTTT  74
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTTTGGCTGCCTGGTGGCGGGGAGGCTGGTGCAAACAGCTGCACAGCAAGTGGCAGAGGATAAATTTGTTTT  74

Query  75  TGACTTACCTGATTATGAAAGTATCAACCATGTTGTGGTTTTTATGCTGGGAACAATCCCATTTCCTGAGGGAA  148
           ||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  75  TGACTTGCCTGATTATGAAAATATCAACCATGTTGTGGTTTTTATGCTGGGAACAATCCCATTTCCTGAGGGCA  148

Query 149  TGGGAGGATCTGTCTACTTTTCTTATCCTGATTCAAATGGAATGCCAGTATGGCAACTCCTAGGATTTGTCACG  222
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGGGAGGATCTGTCTACTTTTCCTATCCTGATTCAAATGGGGTGCCAGTGTGGCAGCTCCTAGGATTTGTCACG  222

Query 223  AATGGGAAGCCAAGTGCCATCTTCAAAATTTCAGGTCTTAAATCTGGAGAAGGAAGCCAACATCCTTTTGGAGC  296
           |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 223  AATGGAAAGCCAAGTGCCATCTTCAAAATATCAGGTCTTAAATCTGGGGAAGGAAGCCAGCACCCATTTGGAGC  296

Query 297  CATGAATATTGTCCGAACTCCATCTGTTGCTCAGATTGGAATTTCAGTGGAATTATTAGACAGTATGGCTCAGC  370
           ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 297  CATGAATATTGTGCGAACCCCATCTGTTGCCCAGATTGGCATCTCGGTGGAATTGTTGGACAGTCTGGCTCAGC  370

Query 371  AGACTCCTGTAGGTAATGCTGCTGTATCCTCAGTTGACTCATTCACTCAGTTCACACAAAAGATGTTGGACAAT  444
           |||||||||||||.|.||||||.||.|||||.||||||||.||.|                             
Sbjct 371  AGACTCCTGTAGGCAGTGCTGCCGTGTCCTCCGTTGACTCCTTTA-----------------------------  415

Query 445  TTCTACAATTTTGCTTCATCATTTGCTGTCTCTCAGGCCCAGATGACACCAAGCCCATCTGAAATGTTCATTCC  518
                                          |.|||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||.||
Sbjct 416  -------------------------------CGCAGGCCCAGATGACACCAAATCCATCAGAAATGTTCATCCC  458

Query 519  GGCAAATGTGGTTCTGAAATGGTATGAAAACTTTCAAAGACGACTAGCACAGAACCCTCTCTTTTGGAAAACA  591
           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 459  AGCAAATGTGGTTCTGAAATGGTATGAAAACTTTCAAAGACGACTAGCACAGAACCCCCTCTTTTGGAAAACA  531