Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03368
• Subject: NM_022420.2
• Aligned Length: 1237
• Identities: 1049
• Gaps: 35

Alignment

Query    1  ATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTTCCTCCTGCTCTTCGTGATCACCTC  74
            ||||||.|||..|.||||||||||||||||.|.||.||.|||.|..||||.|.|||||||.|.|||||..||||
Sbjct    1  ATGTTCCTGGTGTTAGAGAGAAAGATGAGAACCCATCAAGTGTTTCCCTTGCCCCTGCTCCTGGTGATTGCCTC  74

Query   75  GGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACATCCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCTCCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCG  148
            .|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGGCTTCAGAGAACGCCAGCACGTCCCGGGGCTGTGGACTGGACCTTCTTCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCG  148

Query  149  ACCTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCGCCCTGATCACACTGCTCCTGATG  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ACCTGGACGCCATCTGGGGCATCGTGGTGGAGGCAGTGGCCGGGGCGGGGGCCCTGATCACACTGCTTCTGATG  222

Query  223  CTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCATCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGCCCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTT  296
            |||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||.|.||||.|.||||||.|||||||.||.||.||
Sbjct  223  CTCATTCTCCTAGTGAGACTACCCTTCATCAAGGACAAGGAAAGGAAGCGGCCTGTGTGCCTCCATTTCCTCTT  296

Query  297  CCTCCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGGAGGACGAGACCATCTGCTCTG  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||||..
Sbjct  297  CCTGCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGCCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGATGGACGAGACAATCTGCTCCA  370

Query  371  TCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTGCGCTCTGCTTCTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGG  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  TCCGACGCTTCCTCTGGGGTGTCCTCTTCGCGCTCTGCTTTTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCGTGGCGGGTGCGG  444

Query  445  AGGCTGGTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTGGCGCTGTGCCTGATGCTGGTGCA  518
            |||||||||||.||.|||||..||||.||..||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCTGGTGCGCCAGGGCACAAGCCCGGCCAGCTGGCAGCTGGTGAGCCTGGCACTGTGCCTGATGCTGGTGCA  518

Query  519  AGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCACCGTGCTGCGTGACACAAGGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCA  592
            .||||||||.||....||||||||||||||.||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCATCATTGCCACTGAGTGGCTGGTGCTGACTGTGCTGCGTGACACGAAGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCA  592

Query  593  TGGACTTTGTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCCTGGGGCTGGCCCTCTTCACTCTG  666
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|...|||||||||..|.|.||||||||||.|||
Sbjct  593  TGGATTTTGTGATGGCGCTCATCTACGACATGGTGCTGCTGGCCATCACCCTGGCCCAGTCCCTCTTCACGCTG  666

Query  667  TGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGGCCTTCCTCCTCATCACAGCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTG  740
            ||.|||||||||||..||||||||.|||||||.||||||.|||||.||||..||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  TGTGGCAAGTTCAAACGGTGGAAGGTGAACGGAGCCTTCATCCTCGTCACTACCTTCCTCTCTGCGCTCATCTG  740

Query  741  GGTGGCCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTC---AAGCTGCAGCAGGGGGATGCCTGGAACGACCCCA  811
            |||||.||||||||||||||||||||||||||| .||   ||  |..|||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct  741  GGTGGTCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAA-CTCATTAA--TTAAGCAGGGAGATGCCTGGAGCGACCCCA  811

Query  812  CCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCGTCATCTTCCACGCCATCCCTGAGATCCACTGCACC  885
            ||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||.||||
Sbjct  812  CCTTGGCCATTACACTGGCAGCCAGCGGATGGGTCTTTGTCATCTTCCATGCCATTCCGGAGATCCACTACACC  885

Query  886  CTTCTGCCAGCCCTGCAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCCAGGATGCGGGAGACGGCCTT  959
            |||||.|||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  886  CTTCTCCCACCCCTGCAGGAGAACCCACCCAACTACTTCGACACTTCACAGCCCAGGATGCGGGAGACAGCATT  959

Query  960  CGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACAAGGCCTTCTCCATGGATGAACACAATGCAGCTC  1033
            .||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  960  TGATGAGGAAATGCACCTGCCTCGGGCCTACATGGAGAACAAGGCCTTCTCAATGGATGAACATAACGCAGCTC  1033

Query 1034  TCCGAACAGCA---GGATTTCCCAACG---------------------GCAGCTTGGGAAA-AAGACCCAGTGG  1082
            |||||.|||||   ||.|||.||||.|                     |||||.||||||| ||| ||||   |
Sbjct 1034  TCCGATCAGCAGTGGGCTTTTCCAATGGAAGCTTGGAGCAAAGATCTAGCAGCCTGGGAAAGAAG-CCCA---G  1103

Query 1083  CAGCTTGGGGAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGATGGCCGTCGTGCTCA  1156
            |||||||||.||..|.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CAGCTTGGGAAACCGGCCCAGTGCACCGTTCAGAAGCAATGTGTATCAGCCGACCGAGATGGCCGTCGTGCTCA  1177

Query 1157  ACGGTGGGACCATCCCAACTGCTCCGCCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG  1209
            |.||.|||||.||||||||||||||||||..||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1178  ATGGAGGGACTATCCCAACTGCTCCGCCATCTCACACGGGAAGACACCATTGG  1230