Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03440
• Subject: NM_033322.2
• Aligned Length: 898
• Identities: 781
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGGCAGAGTTGGGCCTAAATGAGCACCATCAAAATGAAGTTATTAATTATATGCGTTTTGCTCGTTCAAAGAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGGCAGAGTTGGGCCTAAATGAGCACCATCAAAATGAGGTCATTAATTACATGCGTTTTGCTCGTTCAAAAAG  74

Query  75  AGGCTTGAGACTCAAAACTGTAGATTCCTGCTTCCAAGACCTCAAGGAGAGCAGGCTGGTGGAGGACACCTTCA  148
           ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  75  AGGCTTGAGACTTAAAACGGTAGATTCCTGCTTTCAGGACCTCAAGGACAGCAGGCTGGTGGAGGAGACTTTCA  148

Query 149  CCATAGATGAAGTCTCTGAAGTCCTCAATGGATTACAAGCTGTGGTTCATAGTGAGGTGGAATCTGAGCTCATC  222
           ||||.|||||.||.||.||||||||.|||||..|.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149  CCATTGATGAGGTTTCAGAAGTCCTAAATGGGCTGCAGGCTGTGGTACACAGTGAGGTGGAGTCCGAGCTCATC  222

Query 223  AACACTGCCTATACCAATGTGTTACTTCTGCGACAGCTGTTTGCACAAGCTGAGAAGTGGTATCTTAAGCTACA  296
           ||.||.||.||.||||||||..|.||.||.||.||||||||..|.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223  AATACAGCTTACACCAATGTCCTGCTCCTACGGCAGCTGTTCTCCCAAGCTGAGAAGTGGTATCTAAAGCTACA  296

Query 297  GACAGACATCTCTGAACTTGAAAACCGAGAATTATTAGAACAAGTTGCAGAATTTGAAAAAGCAGAGATTACAT  370
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||..||
Sbjct 297  GACAGACATCTCTGAACTTGAAAACAGAGAATTATTAGAACAAGTTGCTGAATTTGAAAAGGCAGAATTTGTAT  370

Query 371  CTTCAAACAAAAAGCCCATCTTAGATGTCACAAAGCCAAAACTTGCTCCACTTAATGAAGGTGGAACAGCAGAA  444
           ||||||..||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||.||||.||||||||||||||||..||||.
Sbjct 371  CTTCAAGTAAAAAGCCCATCATAGATATCACAAAGCCTAAACTTGTTCCAATTAATGAAGGTGGAACTACAGAG  444

Query 445  CTCCTAAACAAGGAAATTTTAAGACTTCAAGAAGAGAATGAGAAATTGAAGTCAAGGTTGAAGACCATTGAAAT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 445  CTCCTAAACAAGGAAATTTTAAGACTTCAACAAGAGAATGAAAAACTAAAGTCAAGGCTGAAGACCATTGAAAT  518

Query 519  ACAGGCTACAAATGCACTGGATGAAAAGTCAAAACTAGAAAAAGCACTGCAAGATTTACAGCTTGATCAAGGAA  592
           |||||||..||||||.||||||||.|||||||||.|.||||.||.|||.||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 519  ACAGGCTGTAAATGCTCTGGATGAGAAGTCAAAATTGGAAAGAGTACTTCAAGATTTACAGCTCGATCAAGAAA  592

Query 593  ATCAAAAGGATTTTATAAAGGCCCAAGACTTAAGTAACTTAGAAAACACTGTCGCTGC-CTTAAAGAGTGAGTT  665
           |.|||.|||||||..||||||||||||||||...|.||||.|||||.||.||.||..| ||| |.||||||.||
Sbjct 593  ACCAACAGGATTTGCTAAAGGCCCAAGACTTGGATGACTTGGAAAATACAGTTGCAACTCTT-AGGAGTGAATT  665

Query 666  TCAGAAGACACTTAATGACAAGACAGAAAACCAGAAGTCACTGGAGGAGAATCTGGCGACAGCCAAGCACGATC  739
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||.||.||..|||||||.||.||.|
Sbjct 666  TCAGAAGACACTTAATGACAAGACAGAAAACCAAAAATCTTTGGAAGAGAACCTAGCAGCAGCCAAACATGACC  739

Query 740  TACTCAGGGTTCAGGAGCAGCTGCACATGGCTGAAAAGGAATTAGAAAAGAAATTTCAGCAAACAGCAGCTTAT  813
           |.|||||.||.||||||||||||..|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 740  TCCTCAGAGTACAGGAGCAGCTGAGCATGGCTGAAAAGGAGTTAGAGAAGAAATTTCAACAAACAGCAGCTTAT  813

Query 814  CGAAACATGAAAGAGATTCTTACCAAGAAGAATGACCAAATCAAAGATCTGAGGAAAAGACTGGCACAATATGA  887
           ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||..||||||||||||||.|||||||
Sbjct 814  CGAAACATGAAAGAGATTCTCACCAAAAAGAATGATCAAATCAAAGACCTACGGAAAAGACTGGCAAAATATGA  887

Query 888  ACCTGAAGAT  897
           |.||||||||
Sbjct 888  ATCTGAAGAT  897