Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03449
- Subject:
- XM_011245914.2
- Aligned Length:
- 1270
- Identities:
- 973
- Gaps:
- 209
Alignment
Query 1 ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT 66
||| ||||| | ||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT--- 23
Query 67 TACCTTCCTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTC 140
|| .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 24 ----------GA-------GGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTC 80
Query 141 GGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGT 214
.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 81 AGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGT 154
Query 215 ACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGC 288
||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 155 ACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG- 227
Query 289 CCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCA 362
.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 228 --TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCA 299
Query 363 GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCT 436
|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 300 GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTT 373
Query 437 TCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTT 510
||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 374 TCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTT 447
Query 511 AATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA 584
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 AATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA 521
Query 585 ATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAA 658
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 522 ATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGA 595
Query 659 AGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTAT 732
||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 596 AGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTAT 669
Query 733 GCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATA 806
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 670 GCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATA 743
Query 807 TACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAG 880
|||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 744 TACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAG 817
Query 881 GCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTA 954
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 818 GCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTA 891
Query 955 GTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTAC 1028
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 892 GTGTATCAAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCAC 965
Query 1029 CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACA 1102
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGA----------------------------------------------- 992
Query 1103 CCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 ------CAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG 1060
Query 1177 TTGGTGCCA----------------------------------------------------------------- 1185
|||||||||
Sbjct 1061 TTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTG 1134
Query 1186 ------------ 1185
Sbjct 1135 CTGTCAGGCAGC 1146