Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03449
- Subject:
- XM_017023320.2
- Aligned Length:
- 1411
- Identities:
- 1161
- Gaps:
- 236
Alignment
Query 1 ATG----CTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCA-----TCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC--T 63
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Sbjct 1 ATGGAAACTGG----TCAA--AGAACTCATGCAAGTGGAACTTACAGC-TTCCT-TGATCGGAC--TCAGCATT 64
Query 64 C---------------CT----TACCTTCCTG---------GACTGA-----TTCA------------------ 86
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Sbjct 65 CAGATATCAAAGCAGACTGCAATACCTGCGTGGAAATAGAAGACAGAAAGGTTTCAAGACAACAGATGAATTGT 138
Query 87 -----------------GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGC 143
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Sbjct 139 GAAAGAGAGCAGCTAAGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGC 212
Query 144 CCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACA 217
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Sbjct 213 CCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACA 286
Query 218 CAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCG 291
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Sbjct 287 CAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCG 360
Query 292 GCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCC 365
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Sbjct 361 GCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCC 434
Query 366 CCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCA 439
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Sbjct 435 CCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCA 508
Query 440 GGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAAT 513
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Sbjct 509 GGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAAT 582
Query 514 GAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATT 587
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Sbjct 583 GAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATT 656
Query 588 ACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGA 661
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Sbjct 657 ACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGA 730
Query 662 CCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCA 735
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Sbjct 731 CCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCA 804
Query 736 GGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATAC 809
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Sbjct 805 GGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATAC 878
Query 810 TTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCC 883
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Sbjct 879 TTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCC 952
Query 884 GCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTG 957
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Sbjct 953 GCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTG 1026
Query 958 TATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCC 1031
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Sbjct 1027 TATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCC 1100
Query 1032 TGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCT 1105
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Sbjct 1101 TGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCT 1174
Query 1106 CTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTG 1179
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Sbjct 1175 CTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTG 1248
Query 1180 GTGCCA-------------------------------------------------------------------- 1185
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Sbjct 1249 GTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCACACTTCCAGGCCTCTGCTG 1322
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1323 TCAGGCAGCTGAGAATCTGACTGCCTCTCCTCCCCTATTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAAA 1396
Query 1186 ----- 1185
Sbjct 1397 GAAAA 1401