Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03449
• Subject: XM_017023331.2
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1065
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGT  148
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGT  28

Query  149  TTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  TTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGC  102

Query  223  CAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGA  176

Query  297  CACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  CACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGA  250

Query  371  CACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  CACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTC  324

Query  445  CGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCG  398

Query  519  AGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  AGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACG  472

Query  593  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTC  546

Query  667  AACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  AACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCAC  620

Query  741  GGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTG  694

Query  815  CAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  CAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGT  768

Query  889  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCA  842

Query  963  AGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  AGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCA  916

Query 1037  CTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  CTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCA  990

Query 1111  GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  GTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCC  1064

Query 1185  A-------------------------------------------------------------------------  1185
            |                                                                         
Sbjct 1065  ATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCACACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGG  1138

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1139  CAGCTGAGAATCTGACTGCCTCTCCTCCCCTATTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAAAGAAAA  1212