Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03449
- Subject:
- XM_017317005.1
- Aligned Length:
- 1204
- Identities:
- 958
- Gaps:
- 158
Alignment
Query 1 ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT 66
||| ||||| | ||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT--- 23
Query 67 TACCTTCCTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTC 140
|| .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 24 ----------GA-------GGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTC 80
Query 141 GGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGT 214
.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 81 AGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGT 154
Query 215 ACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGC 288
||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 155 ACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG- 227
Query 289 CCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCA 362
.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 228 --TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCA 299
Query 363 GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCT 436
|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 300 GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTT 373
Query 437 TCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTT 510
||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 374 TCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTT 447
Query 511 AATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA 584
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 AATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA 521
Query 585 ATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAA 658
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 522 ATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGA 595
Query 659 AGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTAT 732
||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 596 AGACTGTCAACCCCTACACCAAT--------------------------------------------------- 618
Query 733 GCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATA 806
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 619 ---GGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATA 689
Query 807 TACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAG 880
|||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 690 TACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAG 763
Query 881 GCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTA 954
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 764 GCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGTGTT 837
Query 955 GTGTATCAAGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTATGCTGCATACCGCTAC 1017
||.||.||.|| || |.||||| ||||| ||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 838 GTTTACCAGGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTAT 897
Query 1018 GCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAAT 1091
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 898 GCCCAGCCCACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAAT 971
Query 1092 TTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCC 1165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 972 TTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCC 1045
Query 1166 CACCTACGGCGTTGGTGCCA 1185
||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 CACCTACGGCGTTGGTGCCA 1065