Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03477
• Subject: NM_144536.3
• Aligned Length: 1752
• Identities: 1499
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA  74
            |||||||||||.||.||||||..|||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCCTTCTGCGTCTTGTGATGTACTGCTGGATGACATAGAAGATATCATATCACAGGAAGATTCAAAGCCACA  74

Query   75  AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG  148
            .||.||.||.||...|||||||.||||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||   |
Sbjct   75  GGACAGACAGTTCTCAAGAAAGCATGTGTTTCCTAAAGTACGAAGGCGGAATACCCAAAAATATTTGCAA---G  145

Query  149  AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT  222
            ||||...|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  146  AAGAGCCCAGGCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATCCGAACATGGGGCTGCTCA  219

Query  223  CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC  296
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  220  CATAATAATTCGGATGGAGAATACATGGCTGGACAGCTTGCTGCCTATGGCTATAAAATTACAGAGAATGCATC  293

Query  297  CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA  370
            .|||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  294  AGATGCAGATCTGTGGCTCCTGAACAGTTGTACTGTGAAAAATCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATCA  367

Query  371  AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC  444
            |||||||||||||.|||||.||||||.|.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  368  AAAAAGCTCAAGAAGAGAATAAGAAAGTTGTCCTCGCTGGCTGTGTTCCCCAAGCCCAGCCTCGTCAGGACTAC  441

Query  445  CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG  518
            ||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  442  CTCAAAGGACTGAGCATCATCGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAAACAATAAAAGG  515

Query  519  TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGG-GGAGCACGATTGGATTTGCCG  591
            ||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|.|| ||||||| |||||.|||.|||||||||||
Sbjct  516  TCACTCAGTGAGGCTCCTGGGCCAGAAGAAAGACAACGGGAAGC-GCTTGGGTGGAGCTCGACTGGATTTGCCG  588

Query  592  AAGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAA  665
            |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  AAGATCAGAAAGAATCCGCTGATAGAAATCATTTCCATCAACACGGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAA  662

Query  666  AACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTC  739
            |||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  663  AACTAAACACGCCAGAGGAAACCTGGCCAGCTATCCCATTGATGAGCTTGTGGAGAGAGCCAAGCAATCCTTTC  736

Query  740  AAGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTC  813
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||||
Sbjct  737  AAGAGGGTGTTTGTGAGATATGGCTGACCAGCGAGGACACCGGGGCCTATGGCAGAGACATTGGCACAGATCTC  810

Query  814  CCCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCC  887
            |||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  811  CCCACACTCCTGTGGAAGTTGGTGGAAGTGATTCCTGAGGGAGCCATGCTGAGGCTGGGCATGACAAATCCACC  884

Query  888  CTATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATAC  961
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  885  ATATATTTTAGAACATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTCAACCATCCCAGAGTCTACGCTTTCCTCCACATCC  958

Query  962  CAGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTA  1035
            ||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  959  CAGTGCAGTCCGCCTCTGACAGTGTGCTCATGGACATGAAGAGAGAGTACTGCGTGGCCGACTTCAAAAGAGTC  1032

Query 1036  GTGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAAC  1109
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GTGGATTTTCTCAAGGAGAAGGTTCCTGGAATAACGATTGCTACGGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAAC  1106

Query 1110  AGATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTT  1183
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1107  CGATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTTCCAAGCCTCTTCATCAACCAGTTCT  1180

Query 1184  ACCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGAT  1257
            |.||||||||.||||||||||||||||||...||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1181  ATCCAAGACCCGGAACTCCTGCTGCAAAAGCCGAGCAGGTTCCAGCACATGTGAAAAAACAAAGGACAAAAGAT  1254

Query 1258  CTTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGA  1331
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 1255  CTTTCTCGGGTGTTTCATTCCTACAATCCATACGATCACAAGATTGGCGAAAGACAACAAGTGCTAGTCACTGA  1328

Query 1332  AGAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGGTTTTAGTGCCAAAGAACCCTG  1405
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1329  AGAGTCTTTTGACTCCAAGTTTTATGTTGCTCATAACCGATTCTATGAGCAGGTTTTAGTACCAAAGAACCCTG  1402

Query 1406  CGTTCATGGGGAAGATGGTTGAAGTGGACATCTATGAATCAGGCAAACATTTTATGAAAGGGCAGCCAGTATCT  1479
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.
Sbjct 1403  CATTCATGGGGAAAATGGTTGAAGTCGACATTTACGAATCAGGAAAGCACTTTTTGAAAGGACAGCCAGTATCA  1476

Query 1480  GATGCCAAAGTGTACACGCCCTCCATCAGCAAACCGCTAGCAAAGGGAGAAGTCTCGGGTTTGACAAAGGACTT  1553
            ||..|||.||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1477  GAAACCAGAGTGTATACACCATCCATCAGCAAGCCACTGGCCAAGGGAGAAGTCTCAGGTTTGACAAAGGAATT  1550

Query 1554  CAGAAATGGGCTTGGGAACCAGC------TGAGTTCAGGATCCCACACCTCTGCTGCATCTCAGTGTGACTCAG  1621
            |||||||.||||||||||.||.|      ..|.|||||      ||||||.|.|||||.|||||..||.|||.|
Sbjct 1551  CAGAAATAGGCTTGGGAATCATCCAAACGGAACTTCAG------ACACCTGTCCTGCAACTCAGCATGGCTCTG  1618

Query 1622  CGAGTTCCAGAATGGTGCTGCCCATG-CCAAGGCTACATCAAGACTGTGCGCTGAGGATGTCCGTGGGCTTGGC  1694
            ||..|||||||||||||||||..||| ||       ||..|.|||||.||.||||.|.||.|....|||.||||
Sbjct 1619  CGTATTCCAGAATGGTGCTGCAGATGTCC-------CAGTATGACTGCGCACTGAAGGTGGCTACAGGCCTGGC  1685

Query 1695  TCTGCTGGGTCTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTC------TATAAT-  1737
            |||.||.|.|| ||.||||||.|||.|.|.||...||      ||.||| 
Sbjct 1686  TCTCCTCGCTC-TCCTTTTGCATTTCTGGCCAGACTCTTTGCTTACAATG  1734