Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03477
• Subject: XM_024446481.1
• Aligned Length: 1883
• Identities: 1585
• Gaps: 250

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTCTGCATCCTGTGATACACTACTGGATGACATCGAAGATATCGTGTCTCAGGAAGATTCAAAACCACA  74

Query   75  AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATAGGCATTTTGTAAGAAAGGATGTTGTCCCGAAGGTACGAAGGCGAAATACCCAAAAATATTTGCAAGAGG  148

Query  149  AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAAACAGTCCACCAAGTGACAGCACTATTCCAGGCATACAGAAAATTTGGATACGAACATGGGGTTGTTCT  222

Query  223  CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATAATAATTCAGATGGAGAATATATGGCTGGACAGCTAGCTGCTTATGGCTATAAAATTACAGAAAATGCATC  296

Query  297  CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGATGCAGATTTATGGCTCCTGAACAGTTGCACTGTAAAAAACCCAGCTGAAGACCACTTTAGAAACTCAATTA  370

Query  371  AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAAGCTCAAGAGGAGAACAAGAAAATCGTACTGGCTGGATGCGTTCCTCAAGCCCAGCCTCGCCAGGACTAC  444

Query  445  CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAAGGGACTGAGTATCATTGGGGTTCAGCAGATAGATCGTGTGGTAGAAGTTGTGGAGGAGACAATTAAAGG  518

Query  519  TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCACTCTGTGAGACTGCTGGGTCAGAAAAAGGATAATGGAAGGCGGCTTGGGGGAGCACGATTGGATTTGCCGA  592

Query  593  AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTAGGAAGAATCCACTGATAGAAATCATTTCCATCAATACCGGGTGTCTCAATGCTTGTACCTACTGCAAA  666

Query  667  ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTAAACACGCCAGAGGAAATTTGGCCAGTTATCCAATTGATGAACTAGTAGATAGAGCCAAACAATCTTTTCA  740

Query  741  AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGGGTGTTTGTGAGATATGGTTGACCAGTGAAGACACGGGGGCTTATGGCAGAGATATTGGCACCAATCTCC  814

Query  815  CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCACACTCCTGTGGAAACTGGTTGAAGTGATTCCTGAGGGAGCAATGCTGAGGCTTGGCATGACAAATCCGCCC  888

Query  889  TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATATTTTAGAGCATCTGGAGGAAATGGCAAAAATCCTTAATCACCCCAGAGTCTACGCTTTTCTGCACATACC  962

Query  963  AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCCAGTCTGCCTCCGACAGCGTACTCATGGAAATGAAAAGAGAATACTGTGTGGCTGACTTCAAAAGAGTAG  1036

Query 1037  TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATTTTCTGAAAGAGAAAGTTCCTGGAATAACTATTGCTACAGATATTATCTGTGGTTTTCCTGGAGAAACA  1110

Query 1111  GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCAGGATTTTCAAGAAACAGTGAAACTTGTTGAAGAGTACAAATTCCCAAGCCTGTTTATTAACCAATTTTA  1184

Query 1185  CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCAAGACCAGGAACTCCTGCTGCAAAAATGGAACAAGTTCCAGCACAAGTGAAAAAGCAAAGGACAAAAGATC  1258

Query 1259  TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTCTCGGGTGTTTCATTCTTACAGTCCATATGATCACAAGATTGGTGAAAGACAACAAGTGTTAGTAACAGAA  1332

Query 1333  GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAG---------------GTTTTAGT  1391
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||    |
Sbjct 1333  GAATCTTTTGATTCCAAGTTTTATGTTGCACACAATCAATTCTATGAGCAGATAAGAGGTGAAAATGTT----T  1402

Query 1392  GCCAAAGAACCCTGCGTTCATG----------------GGGAAGATGGTTGAA-------GTGGACATCT---A  1439
            ||.|..||         |||||                |.|||||| |.||||       |||||||..|   |
Sbjct 1403  GCTATGGA---------TCATGGCTGGAATTAGAGCTTGAGAAGAT-GCTGAAGGCCAAGGTGGACAAGTCGGA  1466

Query 1440  TGA---ATCAGGCAAACATTTTATGAAAG--GGCAGCCAGTATCTGATGCC---AAAG-------TGTACACGC  1498
            |||   || .||||.|        |.|||  |||.|||.||.||.||.|.|   ||||       ||.|.|.||
Sbjct 1467  TGAGGGAT-GGGCAGA--------GGAAGCAGGCTGCCTGTGTCAGAAGGCAGGAAAGCAGGAGCTGAAGAGGC  1531

Query 1499  CC-------------TCC-------ATCA--GCAAAC------------CGCTAGCAAA---GGGAGAAGTCTC  1535
            ||             |||       ||||  .||.||            |.|.||.|||   |||||    || 
Sbjct 1532  CCCCAGCATTGACATTCCCCAGGGAATCATCTCAGACTGGGCAGTGCGTCCCCAGGAAACAGGGGAG----CT-  1600

Query 1536  GGGTTTGACAAAG----GACTTCAGAAATGGGC----TTGGGAACCAG------CTG-AGTTCAGGA-----TC  1589
               |||  |||||    ||||    |||.|.||    ||..|.|||.|      ||| ||||.||||     ||
Sbjct 1601  ---TTT--CAAAGCCCAGACT----AAACGTGCTCTGTTCAGTACCGGTGGAGACTGCAGTTGAGGAAGGGCTC  1665

Query 1590  CCA------CACCTCTG--CTGCATCTCAGTGTGACTCAGCGAGTTCCAGAATGGTGCTGCCCATGCCAAGGCT  1655
            |||      ||..||||  |||||||.|                ||||..|.|     |.|||||       ||
Sbjct 1666  CCAGCACTCCATGTCTGGCCTGCATCGC----------------TTCCCCATT-----TCCCCAT-------CT  1711

Query 1656  ACATCA--AGACTGTGCGCTGAGG---ATGTCCGTGGGCTT--GGC------TCTGCT------------GGGT  1704
             |||.|  |.||    |.|.||||   ||.|.|.|   .||  |||      ||||||            ||..
Sbjct 1712  -CATTAATATAC----CCCAGAGGGCCATTTTCCT---ATTCAGGCCAACCTTCTGCTCAGCCCTGGGGAGGAG  1777

Query 1705  CTTCTTTTTGCTTTTTTTGTCAAGGTCTATAAT  1737
            ||                               
Sbjct 1778  CT-------------------------------  1779