Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03523
• Subject: NM_001286247.1
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1671
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGACCTAATGAACGGGCAGGCAAGCAGTGTCAATATTGCAGCTACTGCTTCTGAGAAAAGTAGCAGCTCTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCTAATGAACGGGCAGGCAAGCAGTGTCAATATTGCAGCTACTGCTTCTGAGAAAAGTAGCAGCTCTGA  74

Query   75  ATCCTTAAGTGACAAAGGCTCTGAATTGAAGAAAAGCTTTGATGCTGTGGTATTCGATGTTCTTAAGGTTACAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCCTTAAGTGACAAAGGCTCTGAATTGAAGAAAAGCTTTGATGCTGTGGTATTCGATGTTCTTAAGGTTACAC  148

Query  149  CAGAAGAATATGCGGGTCAGATAACATTAATGGATGTTCCAGTATTTAAAGCTATTCAACCAGATGAGCTTTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGAAGAATATGCGGGTCAGATAACATTAATGGATGTTCCAGTATTTAAAGCTATTCAACCAGATGAGCTTTCA  222

Query  223  AGTTGTGGATGGAATAAAAAAGAAAAATATAGTTCTGCACCAAATGCAGTTGCCTTCACAAGAAGATTCAATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTTGTGGATGGAATAAAAAAGAAAAATATAGTTCTGCACCAAATGCAGTTGCCTTCACAAGAAGATTCAATCA  296

Query  297  TGTAAGCTTTTGGGTTGTTAGAGAGATTCTTCATGCTCAAACATTAAAAATTAGAGCAGAAGTTTTGAGCCACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTAAGCTTTTGGGTTGTTAGAGAGATTCTTCATGCTCAAACATTAAAAATTAGAGCAGAAGTTTTGAGCCACT  370

Query  371  ATATTAAAACTGCTAAGAAACTGTATGAGCTGAATAACCTTCATGCACTTATGGCAGTGGTTTCTGGCCTACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATTAAAACTGCTAAGAAACTGTATGAGCTGAATAACCTTCATGCACTTATGGCAGTGGTTTCTGGCCTACAG  444

Query  445  AGTGCCCCAATTTTCAGGTTGACTAAAACATGGGCGTTATTAAGTCGAAAAGACAAAACTACCTTTGAAAAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGCCCCAATTTTCAGGTTGACTAAAACATGGGCGTTATTAAGTCGAAAAGACAAAACTACCTTTGAAAAATT  518

Query  519  AGAATATGTAATGAGTAAAGAAGATAACTACAAAAGACTCAGAGACTATATAAGTAGCTTAAAGATGACACCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAATATGTAATGAGTAAAGAAGATAACTACAAAAGACTCAGAGACTATATAAGTAGCTTAAAGATGACACCTT  592

Query  593  GCATTCCCTATTTAGGTATCTATTTGTCAGATTTAACATACATCGATTCAGCATACCCATCAACTGGCAGCATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCATTCCCTATTTAGGTATCTATTTGTCAGATTTAACATACATCGATTCAGCATACCCATCAACTGGCAGCATT  666

Query  667  CTAGAAAATGAGCAAAGATCAAATTTAATGAATAATATCCTTCGAATAATTTCTGATTTACAGCAGTCTTGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGAAAATGAGCAAAGATCAAATTTAATGAATAATATCCTTCGAATAATTTCTGATTTACAGCAGTCTTGTGA  740

Query  741  ATATGATATTCCCATGTTGCCTCATGTCCAAAAATATCTCAACTCTGTTCAGTATATAGAAGAACTACAAAAAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATATGATATTCCCATGTTGCCTCATGTCCAAAAATATCTCAACTCTGTTCAGTATATAGAAGAACTACAAAAAT  814

Query  815  TTGTGGAAGACGATAATTACAAGCTTTCATTAAAGATAGAACCAGGGACAAGCACCCCACGTTCTGCTGCTTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTGGAAGACGATAATTACAAGCTTTCATTAAAGATAGAACCAGGGACAAGCACCCCACGTTCTGCTGCTTCC  888

Query  889  AGAGAAGATTTAGTAGGTCCTGAAGTAGGAGCGTCTCCACAGAGTGGACGAAAAAGTGTGGCAGCTGAAGGAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAGAAGATTTAGTAGGTCCTGAAGTAGGAGCGTCTCCACAGAGTGGACGAAAAAGTGTGGCAGCTGAAGGAGC  962

Query  963  CTTGCTCCCACAGACACCGCCATCCCCTCGGAATCTGATTCCACATGGACATAGGAAGTGCCATAGTTTGGGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCTCCCACAGACACCGCCATCCCCTCGGAATCTGATTCCACATGGACATAGGAAGTGCCATAGTTTGGGTT  1036

Query 1037  ATAATTTCATTCATAAAATGAACACAGCAGAATTTAAGAGTGCAACGTTTCCAAATGCAGGACCAAGACATCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATAATTTCATTCATAAAATGAACACAGCAGAATTTAAGAGTGCAACGTTTCCAAATGCAGGACCAAGACATCTG  1110

Query 1111  TTAGATGATAGCGTCATGGAGCCCCATGCGCCATCTCGAGGCCAAGCTGAAAGTTCTACTCTTTCTAGTGGAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTAGATGATAGCGTCATGGAGCCCCATGCGCCATCTCGAGGCCAAGCTGAAAGTTCTACTCTTTCTAGTGGAAT  1184

Query 1185  ATCAATAGGTAGCAGCGATGGTTCTGAACTAAGTGAAGAGACCTCATGGCCTGCTTTTGAAAGGAACAGATTAT  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1185  ATCAATAGGTAGCAGCGATGGTTCTGAACTAAGTGAAGAGACCTCATGGCCTGCTTTTGAA-------------  1245

Query 1259  ACCATTCTCTCGGCCCGGTGACAAGAGTGGCACGAAATGGCTATCGAAGTCACATGAAGGCCAGCAGTTCTGCA  1332
                                                                             |||||||||
Sbjct 1246  -----------------------------------------------------------------AGTTCTGCA  1254

Query 1333  GAATCAGAAGATTTGGCAGTACATTTATATCCAGGAGCTGTTACTATTCAAGGTGTTCTCAGGAGAAAAACTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GAATCAGAAGATTTGGCAGTACATTTATATCCAGGAGCTGTTACTATTCAAGGTGTTCTCAGGAGAAAAACTTT  1328

Query 1407  GTTAAAAGAAGGCAAAAAGCCTACAGTAGCATCTTGGACAAAATATTGGGCAGCTTTGTGTGGGACACAGCTTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  GTTAAAAGAAGGCAAAAAGCCTACAGTAGCATCTTGGACAAAATATTGGGCAGCTTTGTGTGGGACACAGCTTT  1402

Query 1481  TTTACTATGCTGCCAAATCTCTAAAGGCTACCGAAAGAAAACATTTCAAATCAACATCCAATAAGAACGTATCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TTTACTATGCTGCCAAATCTCTAAAGGCTACCGAAAGAAAACATTTCAAATCAACATCCAATAAGAACGTATCT  1476

Query 1555  GTGATAGGATGGATGGTGATGATGGCTGATGACCCTGAACATCCTGATCTCTTCCTGCTGACTGACTCTGAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GTGATAGGATGGATGGTGATGATGGCTGATGACCCTGAACATCCTGATCTCTTCCTGCTGACTGACTCTGAGAA  1550

Query 1629  AGGAAATTCGTACAAGTTTCAAGCTGGCAATAGAATGAATGCAATGTTATGGTTTAAGCATTTGAGTGCAGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  AGGAAATTCGTACAAGTTTCAAGCTGGCAATAGAATGAATGCAATGTTATGGTTTAAGCATTTGAGTGCAGCCT  1624

Query 1703  GCCAAAGTAACAAACAACAGGTTCCTACAAACTTGATGACTTTTGAG  1749
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  GCCAAAGTAACAAACAACAGGTTCCTACAAACTTGATGACTTTTGAG  1671