Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03526
Subject:
NM_001122642.1
Aligned Length:
894
Identities:
644
Gaps:
167

Alignment

Query   1  MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQHGTDAERRHKKLPLTAL  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MKKQFNRMKQLANQTVGRAEKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSMCHHSHKRLIACFQGQHGTDAERRHKKLPLTAL  74

Query  75  AQNMQEASTQLEDSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDW  148
           ||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AQNMQEASAQLEESLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVEKEIMDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDW  148

Query 149  DSVRARWNQAHKSSGTNFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADY  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  DSVRARWNQAHKSSGTNFQGLPSKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADY  222

Query 223  HRKALAVLEKTLPEMRAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKL  296
           ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  HRKALAVLEKALPEMRAHQDKWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKL  296

Query 297  KKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQ  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 297  KKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFSLYEEWTQVASVQDQDKKLQYLWTTCQKLPPQ  370

Query 371  NFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWARNEGTLAEMAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371  NFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWAKQEGTLAEIAAATSVHVVAVIEPIIQHADWFFPG  444

Query 445  EVEFNVSEAFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESFGVKLMDFQAHRRGGTLNRKH  518
           |||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 445  EVEFNVSEAFVPLATPNSNHSSHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKE----------------------  496

Query 519  ISPAFQPPLPPTDGSTVVPAGPEPPPQSSRAESSSGGGTVPSSAGILEQGPSPGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGR  592
                                                                   |||||||.|||||||.||
Sbjct 497  --------------------------------------------------------SPPKPKDSVSAAVPAAGR  514

Query 593  NNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHPPSL  666
           |..|.....||.|....|||||...||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||     ..
Sbjct 515  NSNQMTTVPNQAQTGGNSHQLSVSTPHSAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNLPPGHPGGQSSPGT-----GT  583

Query 667  SPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLS-APRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNPM  739
           ||||..||||||.|...|...|.....|.. ..||.||||.|||||.|||||||||      .....|||    
Sbjct 584  SPKPSARSPSPPQQQQQQQQQQQQQQQQQTPGMRRCSSSLPPIQAPSHPPPQPPTQ------PRLGEQGP----  647

Query 740  ALPSEHGLEQPSHTPPQTPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPP  813
                    .|..||||||||||||||.|||||          ..||.|.| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 648  ---------EPGPTPPQTPTPPSTPPLAKQNPS----------QSETTQLH-GTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPP  701

Query 814  QPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDS------------NSRVSEPHRSIFPEMHSDSASKDVPGRILLDIDND  875
           .|||.|.. |..||...||||.||||.            |                                  
Sbjct 702  HPPGTHTV-DGGLTSSVPTASRIVTDALPGALTGGEGFQN----------------------------------  740

Query 876  TESTAL  881
                 
Sbjct 741  ------  740