Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03535
• Subject: XM_011515442.2
• Aligned Length: 1049
• Identities: 945
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGGACTTTCTGGTCCTCTTCTTGTTCTACCTGGCTTCGGTGCTGATGGGTCTTGTT--------------CTT  60
                                                                .||||              |..
Sbjct    1  ----------------------------------------------------ATGTTGGGAAGAGGAATGCCAG  22

Query   61  ATCTGCGTCTGCTCGAAA---ACCCATAGCTTGAAAGGCCTGGCCAGGGGAGGAGCACAGATATTTTCCTGTAT  131
            |.||||  |.||| ||||   |||||                .|||.|.|      |.|.||||||||||||||
Sbjct   23  AGCTGC--CGGCT-GAAAATTACCCA----------------ACCAAGAG------AAATATATTTTCCTGTAT  71

Query  132  AATTCCAGAATGTCTTCAGAGAGCCGTGCATGGATTGCTTCATTACCTTTTCCATACGAGAAACCACACCTTCA  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  AATTCCAGAATGTCTTCAGAGAGCCGTGCATGGATTGCTTCATTACCTTTTCCATACGAGAAACCACACCTTCA  145

Query  206  TTGTCCTGCACCTGGTCTTGCAAGGGATGGTTTATACTGAGTACACCTGGGAAGTATTTGGCTACTGTCAGGAG  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TTGTCCTGCACCTGGTCTTGCAAGGGATGGTTTATACTGAGTACACCTGGGAAGTATTTGGCTACTGTCAGGAG  219

Query  280  CTGGAGTTGTCCTTGCATTACCTTCTTCTGCCCTATCTGCTGCTAGGTGTAAACCTGTTTTTTTTCACCCTGAC  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  CTGGAGTTGTCCTTGCATTACCTTCTTCTGCCCTATCTGCTGCTAGGTGTAAACCTGTTTTTTTTCACCCTGAC  293

Query  354  TTGTGGAACCAATCCTGGCATTATAACAAAAGCAAATGAATTATTATTTCTTCATGTTTATGAATTTGATGAAG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TTGTGGAACCAATCCTGGCATTATAACAAAAGCAAATGAATTATTATTTCTTCATGTTTATGAATTTGATGAAG  367

Query  428  TGATGTTTCCAAAGAACGTGAGGTGCTCTACTTGTGATTTAAGGAAACCAGCTCGATCCAAGCACTGCAGTGTG  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TGATGTTTCCAAAGAACGTGAGGTGCTCTACTTGTGATTTAAGGAAACCAGCTCGATCCAAGCACTGCAGTGTG  441

Query  502  TGTAACTGGTGTGTGCACCGTTTCGACCATCACTGTGTTTGGGTGAACAACTGCATCGGGGCCTGGAACATCAG  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  TGTAACTGGTGTGTGCACCGTTTCGACCATCACTGTGTTTGGGTGAACAACTGCATCGGGGCCTGGAACATCAG  515

Query  576  GTACTTCCTCATCTACGTCTTGACCTTGACGGCCTCGGCTGCCACCGTCGCCATTGTGAGCACCACTTTTCTGG  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GTACTTCCTCATCTACGTCTTGACCTTGACGGCCTCGGCTGCCACCGTCGCCATTGTGAGCACCACTTTTCTGG  589

Query  650  TCCACTTGGTGGTGATGTCAGATTTATACCAGGAGACTTACATCGATGACCTTGGACACCTCCATGTTATGGAC  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TCCACTTGGTGGTGATGTCAGATTTATACCAGGAGACTTACATCGATGACCTTGGACACCTCCATGTTATGGAC  663

Query  724  ACGGTCTTTCTTATTCAGTACCTGTTCCTGACTTTTCCACGGATTGTCTTCATGCTGGGCTTTGTCGTGGTTCT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  ACGGTCTTTCTTATTCAGTACCTGTTCCTGACTTTTCCACGGATTGTCTTCATGCTGGGCTTTGTCGTGGTTCT  737

Query  798  GAGCTTCCTCCTGGGTGGCTACCTGTTGTTTGTCCTGTATCTGGCGGCCACCAACCAGACTACTAACGAGTGGT  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GAGCTTCCTCCTGGGTGGCTACCTGTTGTTTGTCCTGTATCTGGCGGCCACCAACCAGACTACTAACGAGTGGT  811

Query  872  ACAGAGGTGACTGGGCCTGGTGCCAGCGTTGTCCCCTTGTGGCCTGGCCTCCGTCAGCAGAGCCCCAAGTCCAC  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ACAGAGGTGACTGGGCCTGGTGCCAGCGTTGTCCCCTTGTGGCCTGGCCTCCGTCAGCAGAGCCCCAAGTCCAC  885

Query  946  CGGAACATTCACTCCCATGGGCTTCGGAGCAACCTTCAAGAGATCTTTCTACCTGCCTTTCCATGTCATGAGAG  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CGGAACATTCACTCCCATGGGCTTCGGAGCAACCTTCAAGAGATCTTTCTACCTGCCTTTCCATGTCATGAGAG  959

Query 1020  GAAGAAACAAGAA  1032
            |||||||||||||
Sbjct  960  GAAGAAACAAGAA  972