Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03543
Subject:
NM_001323894.1
Aligned Length:
1410
Identities:
1410
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74

Query   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148

Query  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222

Query  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296

Query  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCTGAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCTGAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTGTTG  370

Query  371  GGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  444

Query  445  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  518

Query  519  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  592

Query  593  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  666

Query  667  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  740

Query  741  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGTGTATGGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGTGTATGGAA  814

Query  815  GCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAGCGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAGCGAG  888

Query  889  AAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTGACTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTGACTG  962

Query  963  TCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGTGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGTGGCT  1036

Query 1037  TTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCTTGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCTTGGC  1110

Query 1111  AGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCCCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCCCTCT  1184

Query 1185  CAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAAGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAAGCAG  1258

Query 1259  GAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTTGGCC  1332

Query 1333  CTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTTTACG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTTTACG  1406

Query 1407  AGAC  1410
            ||||
Sbjct 1407  AGAC  1410