Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03568
• Subject: NM_001303538.2
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1271
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGACAGTCGAGCTTTGGCTAAGGCTCCGGGGAAAGGGTCTAGCCATGCTGCATGTGACCCGGGGGGTCTGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAGTCGAGCTTTGGCTAAGGCTCCGGGGAAAGGGTCTAGCCATGCTGCATGTGACCCGGGGGGTCTGGGG  74

Query   75  GTCCAGGGTCCGAGTATGGCCACTGTTGCCCGCGCTCCTCGGGCCCCCCCGGGCCCTCTCATCGCTGGCAGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCCAGGGTCCGAGTATGGCCACTGTTGCCCGCGCTCCTCGGGCCCCCCCGGGCCCTCTCATCGCTGGCAGCCA  148

Query  149  AAATGGGGGAGTATCGCAAGATGTGGAACCCCAGGGAGCCCCGCGACTGGGCCCAGCAGTACCGCGAGCGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATGGGGGAGTATCGCAAGATGTGGAACCCCAGGGAGCCCCGCGACTGGGCCCAGCAGTACCGCGAGCGCTTC  222

Query  223  ATTCCCTTCTCCAAGGAGCAGCTGCTCCGCCTCCTAATACAGGAATTCCACTCGAGTCCGGCAGAGAAGGCGGC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  223  ATTCCCTTCTCCAAGGAGCAGCTGCTCCGCCTCCTAATA-----------------------------------  261

Query  297  TTTGGAGGCGTTCTCGGCCCACGTGGACTTCTGCACCCTGTTCCACTACCACCAAATCCTGGCCCGGCTGCAGG  370
                                                                                  ||||
Sbjct  262  ----------------------------------------------------------------------CAGG  265

Query  371  CCTTATATGACCCCATCAACCCTGACAGGGAGACCCTCGATCAGCCATCACTAACGGATCCCCAGCGTCTGTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  CCTTATATGACCCCATCAACCCTGACAGGGAGACCCTCGATCAGCCATCACTAACGGATCCCCAGCGTCTGTCT  339

Query  445  AATGAGCAGGAGGTGCTTCGGGCTCTGGAGCCCCTGCTGGCCCAGGCCAACTTCTCCCCGCTGTCTGAGGACAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  AATGAGCAGGAGGTGCTTCGGGCTCTGGAGCCCCTGCTGGCCCAGGCCAACTTCTCCCCGCTGTCTGAGGACAC  413

Query  519  CCTGGCCTACGCGCTGGTGGTCCACCACCCTCAGGATGAGGTCCAGGTGACAGTAAATTTGGATCAGTATGTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  CCTGGCCTACGCGCTGGTGGTCCACCACCCTCAGGATGAGGTCCAGGTGACAGTAAATTTGGATCAGTATGTCT  487

Query  593  ACATTCACTTCTGGGCCCTGGGCCAGCGAGTCGGGCAGATGCCCCTGAAGTCCAGCGTGGGCTCCAGGCGTGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  ACATTCACTTCTGGGCCCTGGGCCAGCGAGTCGGGCAGATGCCCCTGAAGTCCAGCGTGGGCTCCAGGCGTGGC  561

Query  667  TTCTTCACCAAGCTGCCCCCTGCGGAGAGGAGATACTTTAAGCGGGTGGTCCTGGCAGCCCGGACCAAACGGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  TTCTTCACCAAGCTGCCCCCTGCGGAGAGGAGATACTTTAAGCGGGTGGTCCTGGCAGCCCGGACCAAACGGGG  635

Query  741  ACACCTGGTACTGAAGAGTTTCAAGGACACGCCGCTGGAAGGCCTGGAGCAGCTGCTGCCGGAGCTGAAGGTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  ACACCTGGTACTGAAGAGTTTCAAGGACACGCCGCTGGAAGGCCTGGAGCAGCTGCTGCCGGAGCTGAAGGTGC  709

Query  815  GCACGCCCACCCTGCAGCGCGCCCTGCTCAACCTCATGCTGGTAGTCTCCGGCGTGGCGATCTTCGTCAACGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  GCACGCCCACCCTGCAGCGCGCCCTGCTCAACCTCATGCTGGTAGTCTCCGGCGTGGCGATCTTCGTCAACGTG  783

Query  889  GGCATGGTGGTGCTAACCGACCTCAAGGTGGCCACCTCCCTGCTGCTGCTGCTCTTCGCCATCTTCATGGGCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  GGCATGGTGGTGCTAACCGACCTCAAGGTGGCCACCTCCCTGCTGCTGCTGCTCTTCGCCATCTTCATGGGCCT  857

Query  963  GCGGGCCTCCAAGATGTTCGGGCAGCGGCGCAGCGCGCAGGCGTTGGAGCTGGCGCACATGCTGTACTATCGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  GCGGGCCTCCAAGATGTTCGGGCAGCGGCGCAGCGCGCAGGCGTTGGAGCTGGCGCACATGCTGTACTATCGCA  931

Query 1037  GTACGTCCAACAACTCGGAGCTGCTCAGCGCCCTGGCCCTGCGCGCGCAGGACGAGCACACCAAGGAGGCGCTG  1110
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Sbjct  932  GTACGTCCAACAACTCGGAGCTGCTCAGCGCCCTGGCCCTGCGCGCGCAGGACGAGCACACCAAGGAGGCGCTG  1005

Query 1111  CTGGCTCACAGCTTCCTGGCCCGGCGGCCAGGGGGCACTCAAGGCTCGCCCGAAGAGACCTCCAGGTGGCTCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1006  CTGGCTCACAGCTTCCTGGCCCGGCGGCCAGGGGGCACTCAAGGCTCGCCCGAAGAGACCTCCAGGTGGCTCCG  1079

Query 1185  GTCGGAGGTGGAGAACTGGCTCCTAGCCAAGTCAGGCTGTGAGGTGACCTTCAACGGAACTCGGGCCCTGGCGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  GTCGGAGGTGGAGAACTGGCTCCTAGCCAAGTCAGGCTGTGAGGTGACCTTCAACGGAACTCGGGCCCTGGCGC  1153

Query 1259  ATCTGCAGGCCCTGACCCCCAGCATGGGATTGTACCCACCCCCGGGTTTCCCCAAACTAGACCCAGTGGCTCCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  ATCTGCAGGCCCTGACCCCCAGCATGGGATTGTACCCACCCCCGGGTTTCCCCAAACTAGACCCAGTGGCTCCG  1227

Query 1333  ATCACTTCCGAGCCCCCGCAAGCCACGCCCAGCAGTAACATCTCC  1377
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Sbjct 1228  ATCACTTCCGAGCCCCCGCAAGCCACGCCCAGCAGTAACATCTCC  1272