Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03576
• Subject: NM_001320522.1
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1341
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74

Query   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGGTATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGGTATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAG  148

Query  149  AGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAAC  222

Query  223  CAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCTGAA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  223  CAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCT---  293

Query  297  ACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCATTACCCA  370
                                                                                      
Sbjct  294  --------------------------------------------------------------------------  293

Query  371  TGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTC  444
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  ----------------CCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTC  351

Query  445  TTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  TTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGAGCT  425

Query  519  GGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  GGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTC  499

Query  593  GAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  GAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTGGAC  573

Query  667  TGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  TGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGAT  647

Query  741  AGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  AGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTT  721

Query  815  TCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAACTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  TCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAACTG  795

Query  889  AAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  AAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCA  869

Query  963  GGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTA  943

Query 1037  GTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  GTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAGCAG  1017

Query 1111  AGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  AGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGG  1091

Query 1185  CATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATG  1165

Query 1259  AGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  AGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGC  1239

Query 1333  AAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  AAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGA  1313

Query 1407  TTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  TTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1341