Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03594
- Subject:
- NM_018647.5
- Aligned Length:
- 1269
- Identities:
- 1251
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGCTTTAAAAGTGCTACTAGAACAAGAGAAAACGTTTTTCACTCTTTTAGTATTACTAGGCTATTTGTCATG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTTAAAAGTGCTACTAGAACAAGAGAAAACGTTTTTCACTCTTTTAGTATTACTAGGCTATTTGTCATG 74
Query 75 TAAAGTGACTTGTGAATCAGGAGACTGTAGACAGCAAGAATTCAGGGATCGGTCTGGAAACTGTGTTCCCTGCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAAGTGACTTGTGAATCAGGAGACTGTAGACAGCAAGAATTCAGGGATCGGTCTGGAAACTGTGTTCCCTGCA 148
Query 149 ACCAGTGTGGGCCAGGCATGGAGTTGTCTAAGGAATGTGGCTTCGGCTATGGGGAGGATGCACAGTGTGTGACG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCAGTGTGGGCCAGGCATGGAGTTGTCTAAGGAATGTGGCTTCGGCTATGGGGAGGATGCACAGTGTGTGACG 222
Query 223 TGCCGGCTGCACAGGTTCAAGGAGGACTGGGGCTTCCAGAAATGCAAGCCCTGTCTGGACTGCGCAGTGGTGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGCCGGCTGCACAGGTTCAAGGAGGACTGGGGCTTCCAGAAATGCAAGCCCTGTCTGGACTGCGCAGTGGTGAA 296
Query 297 CCGCTTTCAGAAGGCAAATTGTTCAGCCACCAGTGATGCCATCTGCGGGGACTGCTTGCCAGGATTTTATAGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGCTTTCAGAAGGCAAATTGTTCAGCCACCAGTGATGCCATCTGCGGGGACTGCTTGCCAGGATTTTATAGGA 370
Query 371 AGACGAAACTTGTCGGCTTTCAAGACATGGAGTGTGTGCCTTGTGGAGACCCTCCTCCTCCTTACGAACCGCAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGACGAAACTTGTCGGCTTTCAAGACATGGAGTGTGTGCCTTGTGGAGACCCTCCTCCTCCTTACGAACCGCAC 444
Query 445 TGTGCCAGCAAGGTCAACCTCGTGAAGATCGCGTCCACGGCCTCCAGCCCACGGGACACGGCGCTGGCTGCCGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGTGCCAGCAAGGTCAACCTCGTGAAGATCGCGTCCACGGCCTCCAGCCCACGGGACACGGCGCTGGCTGCCGT 518
Query 519 TATCTGCAGCGCTCTGGCCACCGTCCTGCTGGCCCTGCTCATCCTCTGTGTCATCTATTGTAAGAGACAGTTTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATCTGCAGCGCTCTGGCCACCGTCCTGCTGGCCCTGCTCATCCTCTGTGTCATCTATTGTAAGAGACAGTTTA 592
Query 593 TGGAGAAGAAACCCAGCTGGTCTCTGCGGTCACAGGACATTCAGTACAACGGCTCTGAGCTGTCGTGTTTTGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGAGAAGAAACCCAGCTGGTCTCTGCGGTCACAGGACATTCAGTACAACGGCTCTGAGCTGTCGTGTTTTGAC 666
Query 667 AGACCTCAGCTCCACGAATATGCCCACAGAGCCTGCTGCCAGTGCCGCCGTGACTCAGTGCAGACCTGCGGGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGACCTCAGCTCCACGAATATGCCCACAGAGCCTGCTGCCAGTGCCGCCGTGACTCAGTGCAGACCTGCGGGCC 740
Query 741 GGTGCGCTTGCTCCCATCCATGTGCTGTGAGGAGGCCTGCAGCCCCAACCCGGCGACTCTTGGTTGTGGGGTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGCGCTTGCTCCCATCCATGTGCTGTGAGGAGGCCTGCAGCCCCAACCCGGCGACTCTTGGTTGTGGGGTGC 814
Query 815 ATTCTGCAGCCAGTCTTCAGGCAAGAAACGCAGGCCCAGCCGGGGAGATGGTGCCGACTTTCTTCGGATCCCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATTCTGCAGCCAGTCTTCAGGCAAGAAACGCAGGCCCAGCCGGGGAGATGGTGCCGACTTTCTTCGGATCCCTC 888
Query 889 ACGCAGTCCATCTGTGGCGAGTTTTCAGATGCCTGGCCTCTGATGCAGAATCCCATGGGTGGTGACAACATCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACGCAGTCCATCTGTGGCGAGTTTTCAGATGCCTGGCCTCTGATGCAGAATCCCATGGGTGGTGACAACATCTC 962
Query 963 TTTTTGTGACTCTTATCCTGAACTCACTGGAGAAGACATTCATTCTCTCAATCCAGAACTTGAAAGCTCAACGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTTTGTGACTCTTATCCTGAACTCACTGGAGAAGACATTCATTCTCTCAATCCAGAACTTGAAAGCTCAACGT 1036
Query 1037 CTTTGGATTCAAATAGCAGTCAAGATTTGGTTGGTGGGGCTGTTCCAGTCCAGTCTCATTCTGAAAACTTTACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTTGGATTCAAATAGCAGTCAAGATTTGGTTGGTGGGGCTGTTCCAGTCCAGTCTCATTCTGAAAACTTTACA 1110
Query 1111 GCAGCTACTGATTTATCTAGATATAACAACACACTGGTAGAATCAGCATCAACTCAGGATGCACTAACTATGAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGCTACTGATTTATCTAGATATAACAACACACTGGTAGAATCAGCATCAACTCAGGATGCACTAACTATGAG 1184
Query 1185 AAGCCAGCTAGATCAGGAGAGTGGTGCTGTCATCCACCCAGCCACTCAGACGTCCCTCCAGG-AAG-------C 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1185 AAGCCAGCTAGATCAGGAGAGTGGTGCTGTCATCCACCCAGCCACTCAGACGTCCCTCCAGGTAAGGCAGCGAC 1258
Query 1251 T---------- 1251
|
Sbjct 1259 TGGGTTCCCTG 1269