Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03594
• Subject: XM_005266445.3
• Aligned Length: 1269
• Identities: 1251
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCTTTAAAAGTGCTACTAGAACAAGAGAAAACGTTTTTCACTCTTTTAGTATTACTAGGCTATTTGTCATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTTAAAAGTGCTACTAGAACAAGAGAAAACGTTTTTCACTCTTTTAGTATTACTAGGCTATTTGTCATG  74

Query   75  TAAAGTGACTTGTGAATCAGGAGACTGTAGACAGCAAGAATTCAGGGATCGGTCTGGAAACTGTGTTCCCTGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAAGTGACTTGTGAATCAGGAGACTGTAGACAGCAAGAATTCAGGGATCGGTCTGGAAACTGTGTTCCCTGCA  148

Query  149  ACCAGTGTGGGCCAGGCATGGAGTTGTCTAAGGAATGTGGCTTCGGCTATGGGGAGGATGCACAGTGTGTGACG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCAGTGTGGGCCAGGCATGGAGTTGTCTAAGGAATGTGGCTTCGGCTATGGGGAGGATGCACAGTGTGTGACG  222

Query  223  TGCCGGCTGCACAGGTTCAAGGAGGACTGGGGCTTCCAGAAATGCAAGCCCTGTCTGGACTGCGCAGTGGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCCGGCTGCACAGGTTCAAGGAGGACTGGGGCTTCCAGAAATGCAAGCCCTGTCTGGACTGCGCAGTGGTGAA  296

Query  297  CCGCTTTCAGAAGGCAAATTGTTCAGCCACCAGTGATGCCATCTGCGGGGACTGCTTGCCAGGATTTTATAGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCTTTCAGAAGGCAAATTGTTCAGCCACCAGTGATGCCATCTGCGGGGACTGCTTGCCAGGATTTTATAGGA  370

Query  371  AGACGAAACTTGTCGGCTTTCAAGACATGGAGTGTGTGCCTTGTGGAGACCCTCCTCCTCCTTACGAACCGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACGAAACTTGTCGGCTTTCAAGACATGGAGTGTGTGCCTTGTGGAGACCCTCCTCCTCCTTACGAACCGCAC  444

Query  445  TGTGCCAGCAAGGTCAACCTCGTGAAGATCGCGTCCACGGCCTCCAGCCCACGGGACACGGCGCTGGCTGCCGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGCCAGCAAGGTCAACCTCGTGAAGATCGCGTCCACGGCCTCCAGCCCACGGGACACGGCGCTGGCTGCCGT  518

Query  519  TATCTGCAGCGCTCTGGCCACCGTCCTGCTGGCCCTGCTCATCCTCTGTGTCATCTATTGTAAGAGACAGTTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATCTGCAGCGCTCTGGCCACCGTCCTGCTGGCCCTGCTCATCCTCTGTGTCATCTATTGTAAGAGACAGTTTA  592

Query  593  TGGAGAAGAAACCCAGCTGGTCTCTGCGGTCACAGGACATTCAGTACAACGGCTCTGAGCTGTCGTGTTTTGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGAAGAAACCCAGCTGGTCTCTGCGGTCACAGGACATTCAGTACAACGGCTCTGAGCTGTCGTGTTTTGAC  666

Query  667  AGACCTCAGCTCCACGAATATGCCCACAGAGCCTGCTGCCAGTGCCGCCGTGACTCAGTGCAGACCTGCGGGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACCTCAGCTCCACGAATATGCCCACAGAGCCTGCTGCCAGTGCCGCCGTGACTCAGTGCAGACCTGCGGGCC  740

Query  741  GGTGCGCTTGCTCCCATCCATGTGCTGTGAGGAGGCCTGCAGCCCCAACCCGGCGACTCTTGGTTGTGGGGTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGCGCTTGCTCCCATCCATGTGCTGTGAGGAGGCCTGCAGCCCCAACCCGGCGACTCTTGGTTGTGGGGTGC  814

Query  815  ATTCTGCAGCCAGTCTTCAGGCAAGAAACGCAGGCCCAGCCGGGGAGATGGTGCCGACTTTCTTCGGATCCCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTCTGCAGCCAGTCTTCAGGCAAGAAACGCAGGCCCAGCCGGGGAGATGGTGCCGACTTTCTTCGGATCCCTC  888

Query  889  ACGCAGTCCATCTGTGGCGAGTTTTCAGATGCCTGGCCTCTGATGCAGAATCCCATGGGTGGTGACAACATCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACGCAGTCCATCTGTGGCGAGTTTTCAGATGCCTGGCCTCTGATGCAGAATCCCATGGGTGGTGACAACATCTC  962

Query  963  TTTTTGTGACTCTTATCCTGAACTCACTGGAGAAGACATTCATTCTCTCAATCCAGAACTTGAAAGCTCAACGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTTTGTGACTCTTATCCTGAACTCACTGGAGAAGACATTCATTCTCTCAATCCAGAACTTGAAAGCTCAACGT  1036

Query 1037  CTTTGGATTCAAATAGCAGTCAAGATTTGGTTGGTGGGGCTGTTCCAGTCCAGTCTCATTCTGAAAACTTTACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTTGGATTCAAATAGCAGTCAAGATTTGGTTGGTGGGGCTGTTCCAGTCCAGTCTCATTCTGAAAACTTTACA  1110

Query 1111  GCAGCTACTGATTTATCTAGATATAACAACACACTGGTAGAATCAGCATCAACTCAGGATGCACTAACTATGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGCTACTGATTTATCTAGATATAACAACACACTGGTAGAATCAGCATCAACTCAGGATGCACTAACTATGAG  1184

Query 1185  AAGCCAGCTAGATCAGGAGAGTGGTGCTGTCATCCACCCAGCCACTCAGACGTCCCTCCAGG-AAG-------C  1250
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |
Sbjct 1185  AAGCCAGCTAGATCAGGAGAGTGGTGCTGTCATCCACCCAGCCACTCAGACGTCCCTCCAGGTAAGGCAGCGAC  1258

Query 1251  T----------  1251
            |          
Sbjct 1259  TGGGTTCCCTG  1269