Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03598
• Subject: NM_001354998.2
• Aligned Length: 940
• Identities: 790
• Gaps: 143

Alignment

Query   1  ATGGCATTGCTGGTGGACCGAGTGCGGGGCCACTGGCGAATCGCCGCCGGGCTCCTGTTCAACCTGCTGGTGTC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCATTGCTGGTGGACCGAGTGCGGGGCCACTGGCGAATCGCCGCCGGGCTCCTGTTCAACCTGCTGGTGTC  74

Query  75  CATCTGCATTGTGTTCCTCAACAAATGGATTTATGTGTACCACGGCTTCCCCAACATGAGCCTGACCCTGGTGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CATCTGCATTGTGTTCCTCAACAAATGGATTTATGTGTACCACGGCTTCCCCAACATGAGCCTGACCCTGGTGC  148

Query 149  ACTTCGTGGTCACCTGGCTGGGCTTGTATATCTGCCAGAAGCTGGACATCTTTGCCCCCAAAAGTCTGCCGCCC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTTCGTGGTCACCTGGCTGGGCTTGTATATCTGCCAGAAGCTGGACATCTTTGCCCCCAAAAGTCTGCCGCCC  222

Query 223  TCCAGGCTCCTCCTCCTGGCCCTCAGCTTCTGTGGCTTTGTGGTCTTCACTAACCTTTCTCTGCAGAACAACAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCCAGGCTCCTCCTCCTGGCCCTCAGCTTCTGTGGCTTTGTGGTCTTCACTAACCTTTCTCTGCAGAACAACAC  296

Query 297  CATAGGCACCTATCAGCTGGCCAAGGCCATGACCACGCCGGTGATCATAGCCATCCAGACCTTCTGCTACCAGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATAGGCACCTATCAGCTGGCCAAGGCCATGACCACGCCGGTGATCATAGCCATCCAGACCTTCTGCTACCAGA  370

Query 371  AAACCTTCTCCACCAGAATCCAGCTCACGCTGATTCCTATAACTTTAGGTGTAATCCTAAATTCTTATTACGAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AAACCTTCTCCACCAGAATCCAGCTCACGCTGATTCCTATAACTTTAGGTGTAATCCTAAATTCTTATTACGAT  444

Query 445  GTGAAGTTTAATTTCCTTGGAATGGTGTTTGCTGCTCTTGGTGTTTTAGTTACATCCCTTTATCAAGTGTGGGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTGAAGTTTAATTTCCTTGGAATGGTGTTTGCTGCTCTTGGTGTTTTAGTTACATCCCTTTATCAAGTGTGGGT  518

Query 519  AGGAGCCAAACAGCATGAATTACAAGTGAACTCAATGCAGCTGCTGTACTACCAGGCTCCGATGTCATCTGCCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGGAGCCAAACAGCATGAATTACAAGTGAACTCAATGCAGCTGCTGTACTACCAGGCTCCGATGTCATCTGCCA  592

Query 593  TGTTGCTGGTTGCTGTGCCCTTCTTTGAGCCAGTGTTTGGAGAAGGAGGAATATTTGGTCCCTGGTCAGTTTCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGTTGCTGGTTGCTGTGCCCTTCTTTGAGCCAGTGTTTGGAGAAGGAGGAATATTTGGTCCCTGGTCAGTTTCT  666

Query 667  GCTTTGCTTATGGTGCTGCTATCTGGAGTAATAGCTTTCATGGTGAACTTATCAATTTATTGGATCATTGGGAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GCTTTGCTTATGGTGCTGCTATCTGGAGTAATAGCTTTCATGGTGAACTTATCAATTTATTGGATCATTGGGAA  740

Query 741  CACTTCACCTGTCACCTATAACATGTTCGGACACTTCAAGTTCTGCATTACTTTATTCGGAGGATATGTTTTAT  814
           |||||||||||||||                    ||||                       ||.|||      
Sbjct 741  CACTTCACCTGTCAC--------------------TCAA-----------------------GAAATG------  765

Query 815  TTAAGGATCCACTGTCCATTAATCAGGCC-CTTGGCATTTTATGTACATTATTTGGCATTCTCGCCTATACCCA  887
             |||          .||||     |||| ..||.||                ||||  ||.|||||.      
Sbjct 766  --AAG----------TCATT-----GGCCGGGTGCCA----------------TGGC--TCACGCCTG------  798

Query 888  CTTTAAGCTCAGTGAACAGGAAGGAAGTAGGAGTAAACTGGCACAACGTCCT  939
                                                               
Sbjct 799  ----------------------------------------------------  798