Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03616
- Subject:
- NM_001114120.3
- Aligned Length:
- 2433
- Identities:
- 1581
- Gaps:
- 852
Alignment
Query 1 ATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCG 74
Query 75 AGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAG 148
Query 149 TGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAA 222
Query 223 CTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGA 296
Query 297 TAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAA 370
Query 371 AAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCT 444
Query 445 AAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGAAATAATCAATGAAGATCAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGAAATAATCAATGAAGATCAAGA 518
Query 519 AAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCTACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCTACC 592
Query 593 TGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATAATG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATAATG 666
Query 667 TACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTGGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTGGGT 740
Query 741 ATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGATTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGATTTG 814
Query 815 AACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATATTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATATTAC 888
Query 889 GAATTATTTGTAAACATTTTGG---------------------------------------------------- 910
||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAATTATTTGTAAACATTTTGGTTGTTTGTGGCTACATCACAGTTTCAGATAGATCCAGTGGGATACATAAAAT 962
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 963 TCAAGATGATCCACAGTCTTCAAAATTCCTTCACTTAAACAATTTGAATTCCTTCAAATCAACTGAGTGCCTTC 1036
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1037 TTCTCAGTCTGCTTCATAGAGAAAAAAACAAAGAAGAATCAGATTCTACTGAGAGACTACAGATAAGCAATCCA 1110
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1111 GGATTTCAAGAAAGATGTGCTAAGAAAATGCAGCTAGTTAATTTAAGAAACAGAAGAGTGAGTGCTAATGACAT 1184
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1185 AATGGGAGGAAGTTGTCATAATTTAATAGGGTTAAGTAATATGCATGATCTATCCTCTAACAGCAAACCAAGGT 1258
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1259 GCTGTTCTTTGGAAGGAATTGTAGATGTGCCAGGGAATTCAAGTAAAGAGGCATCCAGTGTCTTTCATCAATCT 1332
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1333 TTTCCGAACATAGAAGGACAAAATAATAAACTGTTTTTAGAGTCTAAGCCCAAACAGGAATTCCTGTTGAATCT 1406
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1407 TCATTCAGAGGAAAATATTCAAAAGCCATTCAGTGCTGGTTTTAAGAGAACCTCTACTTTGACTGTTCAAGACC 1480
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1481 AAGAGGAGTTGTGTAATGGGAAATGCAAGTCAAAACAGCTTTGTAGGTCTCAGAGTTTGCTTTTAAGAAGTAGT 1554
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1555 ACAAGAAGGAATAGTTATATCAATACACCAGTGGCTGAAATTATCATGAAACCAAATGTTGGACAAGGCAGCAC 1628
Query 911 -------------------------------------------------------------------------- 910
Sbjct 1629 AAGTGTGCAAACAGCTATGGAAAGTGAACTCGGAGAGTCTAGTGCCACAATCAATAAAAGACTCTGCAAAAGTA 1702
Query 911 ------------------------------------------------------------GCTTGCTGCAACCT 924
||||||||||||||
Sbjct 1703 CAATAGAACTTTCAGAAAATTCTTTACTTCCAGCTTCTTCTATGTTGACTGGCACACAAAGCTTGCTGCAACCT 1776
Query 925 CATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTTATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCT 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTTATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCT 1850
Query 999 TCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTCAAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTA 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTCAAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTA 1924
Query 1073 CGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGTGTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTT 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGTGTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTT 1998
Query 1147 CTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCATCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGAC 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCATCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGAC 2072
Query 1221 TGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGGGACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTT 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGGGACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTT 2146
Query 1295 TGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCTCAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCT 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCTCAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCT 2220
Query 1369 GCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAACAGGAGTTTACCTCTAAAGGAGAAAAGAAAAAAACTAAA 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAACAGGAGTTTACCTCTAAAGGAGAAAAGAAAAAAACTAAA 2294
Query 1443 ACAGTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGAAAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTG 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACAGTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGAAAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTG 2368
Query 1517 GTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATTTTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGA 1581
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATTTTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGA 2433