Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03660
• Subject: XM_011523230.2
• Aligned Length: 2232
• Identities: 1974
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCTGCCAGCAGTCGCGGTACCACAGCTTCTCGTCCGCGTCGAGATTACAGCCACGGCCTTCAGGAGTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATAGACGAATCCTTTCTCACAGAAGACAAGAGCACCCAGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAACGAAGGACGCTGA  148

Query    1  --------------ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGTCAGTTCTCCATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAAT  222

Query   61  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAAAACCCTGTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCC  296

Query  135  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGTACTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCC  370

Query  209  AGGAACTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTA  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAACTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTA  444

Query  283  CTATCCTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCT  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTATCCTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCT  518

Query  357  GAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATG  592

Query  431  AAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCA  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCA  666

Query  505  TTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGC  740

Query  579  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAG  814

Query  653  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAG  888

Query  727  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGAC  962

Query  801  CAACAAGGATCTTCAGGAG---------------------CAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGG  853
            |||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAACAAGGATCTTCAGGAGCAGGGCCAATGTCCTTGCCCACAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGG  1036

Query  854  TTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAG  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAG  1110

Query  928  CTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA---------------------  980
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 1111  CTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGG  1184

Query  981  ------------------------------------------------------AGATGTGGTGGCTGGGGGCC  1000
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCAGGTCCTGCTTACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCC  1258

Query 1001  CAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGT  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGT  1332

Query 1075  TCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTT  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTT  1406

Query 1149  TGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAAC  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAAC  1480

Query 1223  GTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGT  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGT  1554

Query 1297  GATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTT  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTT  1628

Query 1371  CTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGA  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGA  1702

Query 1445  AGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGT  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGT  1776

Query 1519  ACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAA  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAA  1850

Query 1593  TGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAAC  1666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAAC  1924

Query 1667  TCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCAT  1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCAT  1998

Query 1741  GAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAA  1814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAA  2072

Query 1815  CACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCG  1888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCG  2146

Query 1889  TGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCA  1962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCA  2220

Query 1963  GAGCCTGCAAGC  1974
            ||||||||||||
Sbjct 2221  GAGCCTGCAAGC  2232