Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03660
- Subject:
- XM_017023445.2
- Aligned Length:
- 2114
- Identities:
- 1847
- Gaps:
- 250
Alignment
Query 1 ATGGGTGGGCACCTGTCCCCA-TGGC----CCACA---------------------TACA-CCAGTGGCC---- 43
|||| ||||.|..|| |.|| ||||| |||| ||| .||||
Sbjct 1 ATGG-------CCTGCCAGCAGTCGCGGTACCACAGCTTCTCGTCCGCGTCGAGATTACAGCCA-CGGCCTTCA 66
Query 44 ----AGACCAT----------TTT--------------------GCAAAATCGAAAACCCTGTTCAGATGACTA 83
.|||||| ||| .||.||||| .||.|.|.|||||| .||
Sbjct 67 GGAGTGACCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAAGACAAGAGCACCCAGAATCG-CAAGCTTCTTCAGA-AAC-- 136
Query 84 CCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGGAACTGGAAA 157
|||| ||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 ---GAAG-GACGCTGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGGAACTGGAAA 206
Query 158 ACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTGCAGCCTTAC 231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 ACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTGCA------- 273
Query 232 AGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTACTATCCTCCATCAAGAATGCGTA 305
Sbjct 274 -------------------------------------------------------------------------- 273
Query 306 TGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGA 379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 -------------GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGA 334
Query 380 ATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAG 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 ATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAG 408
Query 454 AAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACT 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 AAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACT 482
Query 528 GAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACC 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 GAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACC 556
Query 602 TGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTG 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTG 630
Query 676 AAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGC 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGC 704
Query 750 CAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGC 778
Query 824 TGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACG 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 TGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACG 852
Query 898 CTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGAC 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 CTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGAC 926
Query 972 CAAGTGCAA----------------------------------------------------------------- 980
|||||||||
Sbjct 927 CAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGGCCCCAGGTCCTGCTTACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCT 1000
Query 981 ----------AGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 CCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAG 1074
Query 1045 CTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTA 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTA 1148
Query 1119 TGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGG 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 TGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGG 1222
Query 1193 TCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTC 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 TCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTC 1296
Query 1267 AATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGAT 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 AATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGAT 1370
Query 1341 CTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCA 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 CTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCA 1444
Query 1415 CCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACC 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 CCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACC 1518
Query 1489 ATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGA 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 ATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGA 1592
Query 1563 GGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 GGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGG 1666
Query 1637 AGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAG 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 AGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAG 1740
Query 1711 CTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCAT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 CTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCAT 1814
Query 1785 CGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGC 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 CGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGC 1888
Query 1859 CAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATT 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 CAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATT 1962
Query 1933 GACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 GACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC 2004