Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03660
• Subject: XM_017023449.2
• Aligned Length: 2039
• Identities: 1736
• Gaps: 286

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCACCTGTCCCCA-TGGC----CCACA---------------------TACA-CCAGTGGCC----  43
            ||||       ||||.|..|| |.||    |||||                     |||| ||| .||||    
Sbjct    1  ATGG-------CCTGCCAGCAGTCGCGGTACCACAGCTTCTCGTCCGCGTCGAGATTACAGCCA-CGGCCTTCA  66

Query   44  ----AGACCAT----------TTT--------------------GCAAAATCGAAAACCCTGTTCAGATGACTA  83
                .||||||          |||                    .||.||||| .||.|.|.|||||| .||  
Sbjct   67  GGAGTGACCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAAGACAAGAGCACCCAGAATCG-CAAGCTTCTTCAGA-AAC--  136

Query   84  CCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGGAACTGGAAA  157
               |||| ||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  ---GAAG-GACGCTGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGGAACTGGAAA  206

Query  158  ACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTGCAGCCTTAC  231
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  207  ACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTGCA-------  273

Query  232  AGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTACTATCCTCCATCAAGAATGCGTA  305
                                                                                      
Sbjct  274  --------------------------------------------------------------------------  273

Query  306  TGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGA  379
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  -------------GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGA  334

Query  380  ATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAG  453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  ATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAG  408

Query  454  AAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACT  527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  AAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACT  482

Query  528  GAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACC  601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  GAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACC  556

Query  602  TGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTG  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  TGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTG  630

Query  676  AAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGC  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  AAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGC  704

Query  750  CAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGC  823
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  705  CAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGA-----  773

Query  824  TGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACG  897
                                                                                      
Sbjct  774  --------------------------------------------------------------------------  773

Query  898  CTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGAC  971
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  --------------------------------GCAGGAGATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGAC  815

Query  972  CAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGC  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  CAAGTGCAAAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGC  889

Query 1046  TGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTAT  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  TGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTAT  963

Query 1120  GGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGT  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  GGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGT  1037

Query 1194  CAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCA  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038  CAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCA  1111

Query 1268  ATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATC  1341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112  ATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATC  1185

Query 1342  TTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCAC  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186  TTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCAC  1259

Query 1416  CCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCA  1489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260  CCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCA  1333

Query 1490  TGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAG  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334  TGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAG  1407

Query 1564  GCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGA  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408  GCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGA  1481

Query 1638  GGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGC  1711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482  GGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGC  1555

Query 1712  TAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATC  1785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556  TAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATC  1629

Query 1786  GACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCC  1859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630  GACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCC  1703

Query 1860  AGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTG  1933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704  AGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTG  1777

Query 1934  ACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778  ACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1818