Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03660
- Subject:
- XM_024450350.1
- Aligned Length:
- 2076
- Identities:
- 1800
- Gaps:
- 231
Alignment
Query 1 ATGGGTGGGCAC---CTGTCCCCATGGCCCACATACACCAG-TGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCT 70
.|||..|| ||||.|.| |||..||| |..||||.|| .|..
Sbjct 1 ----ATGGCGACCGGCTGTACGC----------TACCACAGCTTCCCAGGCC------------------GCGG 42
Query 71 GTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGG----GAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTA 140
||.|.|||..| |||...||..||.|| |..|||||||||| ||||..|.||| |||
Sbjct 43 GTGCTGATTGC--CCGCCTGCCCGTGGGTCATGGCCTGCCAGCAG--------TCGCGGTACCA-----CAG-- 99
Query 141 CTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGC-TGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAA 213
||| |||.||| || |.| |||||.||.|||
Sbjct 100 CTT-------------------------------CTCGTCC-GCGTCG----------AGATTACAGCCA---- 127
Query 214 CTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGA---CTT-----CAAAACGTACAAG--- 276
|.||||| ||| ||| ||| .||||||.|| ||| ||.|| .|||||
Sbjct 128 ---------CGGCCTT-CAG-GAG-----TGA-----CCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAA--GACAAGAGC 178
Query 277 --CCATTACTATC-----CTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG 343
|| |..||| ||.|.|||..|| ||.| |||.||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 ACCC---AGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAA--CGAA-----GGACGCT-GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG 241
Query 344 CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT 315
Query 418 GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA 389
Query 492 GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA 463
Query 566 GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464 GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA 537
Query 640 GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT 611
Query 714 GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA 685
Query 788 TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG 759
Query 862 GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA 833
Query 936 GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA----------------------------- 980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGGCCCCAGGT 907
Query 981 ----------------------------------------------AGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGC 1008
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 CCTGCTTACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGC 981
Query 1009 TGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCT 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 TGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCT 1055
Query 1083 GCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCC 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 GCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCC 1129
Query 1157 TCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCT 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCT 1203
Query 1231 GAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCAT 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 GAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCAT 1277
Query 1305 GGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAG 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 GGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAG 1351
Query 1379 TCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATG 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 TCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATG 1425
Query 1453 ACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCC 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 ACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCC 1499
Query 1527 TCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACT 1573
Query 1601 TGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 TGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAA 1647
Query 1675 CAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGT 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648 CAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGT 1721
Query 1749 GACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACA 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 GACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACA 1795
Query 1823 TGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAA 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 TGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAA 1869
Query 1897 ATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGC 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 ATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGC 1943
Query 1971 AAGC 1974
||||
Sbjct 1944 AAGC 1947