Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03680
Subject:
NM_001178033.2
Aligned Length:
691
Identities:
509
Gaps:
182

Alignment

Query   1  ATGGCAGATGAGCAAGAAATCATGTGCAAATTGGAAAGCATTAAAGAGATCAGGAACAAGACCCTGCAGATGGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCAGATGAGCAAGAAATCATGTGCAAATTGGAAAGCATTAAAGAGATCAGGAACAAGACCCTGCAGATGGA  74

Query  75  GAAGATCAAGGCTCGTTTGAAGGCTGAGTTTGAGGCACTTGAGTCAGAGGAAAGGCACCTGAAGGAATACAAGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAAGATCAAGGCTCGTTTGAAGGCTGAGTTTGAGGCACTTGAGTCAGAGGAAAGGCACCTGAAGGAATACAAGC  148

Query 149  AGGAGATGGACCTTCTGCTACAGGAGAAGATGGCCCATGTGGAGGAACTCCGACTGATCCACGCTGACATCAAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGGAGATGGACCTTCTGCTACAGGAGAAGATGGCCCATGTGGAGGAACTCCGACTGATCCACGCTGACATCAAT  222

Query 223  GTGATGGAAAACACTATCAAACAATCTGAGAATGACCTAAACAAGCTGCTAGAGTCTACAAGGAGGCTGCATGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GTGATGGAAAACACTATCAAACAATCTGAGAATGACCTAAACAAGCTGCTAGAGTCTACAAGGAGGCTGCATGA  296

Query 297  TGAGTATAAGCCACTGAAAGAACATGTGGATGCCCTGCGCATGACTCTGGGCCTGCAGAGGCTCCCTGACTTGT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGAGTATAAGCCACTGAAAGAACATGTGGATGCCCTGCGCATGACTCTGGGCCTGCAGAGGCTCCCTGACTTGT  370

Query 371  GTGAAGAAGAGGAGAAGCTTTCCTTGGATTACTTTGAGAAGCAGAAAGCAGAATGGCAGACAGAACCTCAGGAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 371  GTGAAGAAGAGGAGAAGCTTTCCTTGGA----------------------------------------------  398

Query 445  CCCCCCATCCCTGAGTCCCTGGCCGCTGCAGCCGCTGCCGCCCAACAGCTCCAAGTGGCTAGGAAGCAGGATAC  518
                                                                                     
Sbjct 399  --------------------------------------------------------------------------  398

Query 519  TCGGCAGACGGCCACCTTCAGGCAGCAGCCCCCACCTATGAAGGCCTGCTTGTCATGTCACCAGCAAATTCACC  592
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399  -------------------------------------------GCCTGCTTGTCATGTCACCAGCAAATTCACC  429

Query 593  GGAATGCACCTATATGCCCTCTTTGCAAGGCCAAGAGTCGGTCCCGGAACCCCAAAAAGCCGAAACGGAAGCAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430  GGAATGCACCTATATGCCCTCTTTGCAAGGCCAAGAGTCGGTCCCGGAACCCCAAAAAGCCGAAACGGAAGCAG  503

Query 667  GATGAA-------------------  672
           ||||||                   
Sbjct 504  GATGAATAAAGAAAGGGAGAGCACA  528