Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03722
- Subject:
- NM_001168568.1
- Aligned Length:
- 1761
- Identities:
- 1544
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGAAGTACATCCTGGTCACGGGTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATCATTGCCAGCAGCATTGGAAC 74
||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGAAGTATATCCTGGTTACTGGTGGGGTCATCTCAGGCATTGGTAAAGGGATTATCGCCAGCAGCATTGGGAC 74
Query 75 GATTCTAAAATCATGTGGACTCCGAGTTACTGCCATAAAAATCGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGCACTT 148
.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TATTCTCAAGTCATGTGGACTCCGAGTTACTGCCATCAAAATTGACCCCTATATTAACATCGATGCTGGAACTT 148
Query 149 TTTCACCTTATGAACACGGTGAAGTCTTCGTCTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTAGACCTTGGAAATTAT 222
|.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 149 TCTCACCTTATGAACATGGTGAAGTATTTGTTTTAAATGATGGTGGAGAAGTTGATTTGGACCTTGGAAACTAT 222
Query 223 GAAAGATTTTTGGATATTAATCTTTATAAAGACAACAATATCACCACGGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAA 296
||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAGATTCTTGGACATTAATCTCTATAAAGACAACAACATCACCACTGGGAAGATATATCAGCATGTGATCAA 296
Query 297 TAAAGAGAGGCGTGGTGATTACCTGGGGAAAACAGTGCAAGTTGTCCCTCACATTACTGATGCTGTCCAGGAGT 370
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 297 CAAAGAGAGGCGCGGTGATTACCTGGGGAAAACTGTTCAAGTTGTCCCCCATATTACTGATGCTATCCAGGAGT 370
Query 371 GGGTTATGAATCAAGCCAAGGTGCCGGTGGATGGTAATAAGGAAGAGCCCCAAATATGCGTTATTGAGCTGGGA 444
|||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 GGGTTATGAATCAAGCCAAGGTGTCTGTGGATGGCAATAAGGAAGATCCCCAGATATGTGTTATTGAGCTGGGA 444
Query 445 GGCACCATTGGAGACATCGAAGGAATGCCGTTTGTGGAGGCGTTTAGACAATTCCAGTTTAAGGCGAAAAGAGA 518
|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||..||||.|||||||||||.||.||.|.|||
Sbjct 445 GGCACCATTGGAGACATTGAAGGAATGGCATTTGTGGAAGCATTCCGACAGTTCCAGTTTAAAGCCAAGAAAGA 518
Query 519 GAATTTCTGTAATATCCACGTTAGCCTTGTCCCACAGCTCAGTGCTACCGGAGAACAAAAAACCAAACCCACCC 592
||||||||.||||||.||.||.||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 519 GAATTTCTATAATATTCATGTCAGCCTTGTGCCACAGCCCAGTGCTACTGGAGAACAAAAAACCAAGCCCACGC 592
Query 593 AAAACAGCGTCCGCGCACTGAGGGGTTTAGGCCTGTCTCCAGATCTGATTGTCTGCCGAAGTTCAACGCCCATT 666
|||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 AAAACAGTGTCCGTGCGCTGAGAGGGTTGGGCTTGTCTCCGGATCTGATCGTCTGCCGTAGTTCAACCCCCATT 666
Query 667 GAGATGGCCGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATATGTATCCATGATGT 740
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GAGATGGCTGTGAAGGAGAAGATTTCTATGTTTTGTCACGTGAACCCTGAACAGGTCATCTGTATCCATGATGT 740
Query 741 TTCTTCCACATACCGAGTTCCTGTGCTTTTAGAGGAACAAAGCATTGTGAAATATTTTAAGGAGAGATTGCACC 814
||||||||..||||||||.|||.|.|||||.|||||.|||.|..|.||.|||||||||.|.|||||||||..||
Sbjct 741 TTCTTCCATCTACCGAGTGCCTCTCCTTTTGGAGGAGCAAGGTGTGGTTAAATATTTTCAAGAGAGATTGGGCC 814
Query 815 TGCCCATCGGTGATTCTGCAAGTAATTTGCTTTTTAAGTGGAGAAATATGGCTGACAGGTATGAAAGGTTACAG 888
||||||||..|||||.|.||||||||||||||||.|||||||.|...|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 815 TGCCCATCAATGATTGTTCAAGTAATTTGCTTTTCAAGTGGAAAGCCATGGCTGACAGGTATGAGAGATTGCAG 888
Query 889 AAAATATGCTCCATAGCCCTGGTTGGCAAATACACCAAGCTCAGAGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCCCT 962
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 AAAATATGTTCCATAGCCCTGGTTGGTAAATACACCAAACTCAGGGACTGCTACGCCTCTGTGTTCAAAGCACT 962
Query 963 GGAACACTCAGCCCTGGCCATCAACCACAAGTTGAATCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAG-AAGATC 1035
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||| .|| ||
Sbjct 963 GGAACACTCAGCCTTGGCCATCAACCACAAGTTGAACCTGATGTACATAGACTCCATTGATCTGGAGCCAG-TC 1035
Query 1036 ACTGAAACCGAGGACCCTGTGAAATTTCATGAAGCTTGGCAGAAGCTATGCAAAGCTGATGGTATTCTTGTGCC 1109
||..||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036 ACCAAAGCCGAGGATCCTGTGAAATTCCATGAAGCTTGGCAGAAGCTGTGCTTAGCTGATGGGATTCTTGTGCC 1109
Query 1110 TGGAGGCTTTGGAATCAGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCGATTTCTTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCTT 1183
.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1110 CGGAGGGTTTGGAATCCGAGGAACATTGGGAAAACTCCAGGCAATTTCGTGGGCAAGGACAAAGAAGATTCCAT 1183
Query 1184 TTCTGGGAGTTTGTCTTGGGATGCAACTAGCAGTGATAGAGTTTGCAAGAAACTGCCTTAACTTGAAAGATGCT 1257
||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1184 TTCTGGGAATTTGCCTTGGGATGCAACTGGCAGTGATTGAGTTTGCAAGAAACTGCCTGAACTTGAAAGATGCT 1257
Query 1258 GATTCCACAGAGTTTAGGCCAAATGCCCCAGTTCCTCTGGTGATTGATATGCCCGAGCACAACCCTGGCAATTT 1331
.||||.|||||.|||..||||||..|.|||||.||..||||.|||||.|||||.||.||||||||||||.||||
Sbjct 1258 AATTCTACAGAATTTGAGCCAAACACTCCAGTCCCATTGGTAATTGACATGCCTGAACACAACCCTGGCGATTT 1331
Query 1332 GGGAGGAACAATGAGACTGGGAATAAGAAGAACTGTTTTCAAAACTGAAAATTCAATATTAAGGAAACTTTATG 1405
|||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||.|||||||||.||.|||.|.|.|||.|||||||
Sbjct 1332 GGGAGGAACAATGAGACTGGGGTTAAGACGAACTGTTTTCACAACTGAAAACTCCATACTGAAGAAGCTTTATG 1405
Query 1406 GTGATGTTCCTTTTATAGAAGAAAGACACAGACATCGGTTCGAGGTAAACCCTAACCTGATCAAACAATTTGAG 1479
||||.|||||||..|||||||||||||||.|||||||.|..|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1406 GTGACGTTCCTTACATAGAAGAAAGACACCGACATCGCTATGAGGTGAACCCTAACCTGATCAACCAATTTGAG 1479
Query 1480 CAGAATGACTTAAGTTTTGTAGGTCAGGATGTTGATGGAGACAGGATGGAAATCATTGAACTGGCAAATCATCC 1553
.|.||.|||.|..|||||||.|||.|||||||.|||||..|.|||||||||||..||||..||.|||.||||||
Sbjct 1480 AATAAAGACCTTTGTTTTGTCGGTGAGGATGTAGATGGGAAGAGGATGGAAATTGTTGAGTTGACAAGTCATCC 1553
Query 1554 TTATTTTGTTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCTTCTAGGCCGATGAAGCCTTCCCCTCCGTATCTGGGGC 1627
.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1554 ATATTTCATTGGTGTCCAGTTCCATCCTGAGTTTTCCTCTAGGCCAATGAAGCCTTCCCCTCCGTACCTGGGGC 1627
Query 1628 TGTTACTTGCAGCAACTGGGAACCTGAATGCCTACTTGCAACAGGGTTG--CAAACTGTCTTCCAGTGATAGAT 1699
|.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|..||||.|| |.|| |||.|||.|.|.|||||||.|||
Sbjct 1628 TCTTACTTGCAGCAACGGGGAATCTGAATGCCCATCTGCAGCA--GATGAACAAGCTGCCATACAGTGATGGAT 1699
Query 1700 ACAGTGATGCCAGTGATGACAGCTTTTCAGAGCCAAGGATAGCTGAGTTGGAAATAAGC 1758
|||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||.|.|.|||||..||||..|.|.|
Sbjct 1700 ACAGTGATGCCAGCGATGACAGCTTTCCAGAGGCAAAGCTTGCTGAACTGGATCTCAAC 1758