Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03749
• Subject: XM_011529660.2
• Aligned Length: 1186
• Identities: 1016
• Gaps: 170

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGGCCTGCTGGCCT  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCAGAGGACGGCTGTCCTCAGCGAGGGGCCGTGCACCCGCTCCTGAGCAGCGCCATGGGCCTGCTGGCCT  74

Query   17  TCCTGAAGACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGGTCTGGTCATCAACTTC  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct   75  TCCTGAAGACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTG------------------------  124

Query   91  GTCCAGCTGTGCACGCTGGCGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCAACTGCCGCCTCGCCTA  164
                                                                                      
Sbjct  125  --------------------------------------------------------------------------  124

Query  165  CTCACTCTGGAGCCAACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGG  238
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  --------------AACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGG  184

Query  239  CCACGGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGT  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  CCACGGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGT  258

Query  313  GGGTGGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGT  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GGGTGGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGT  332

Query  387  GCCCCTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACA  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  GCCCCTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACA  406

Query  461  CCGTGGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACG  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  CCGTGGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACG  480

Query  535  CGCTTCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCA  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CGCTTCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCA  554

Query  609  CCTGCTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATG  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  CCTGCTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATG  628

Query  683  TAACCCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGAC  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  TAACCCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGAC  702

Query  757  ATGTGCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACT  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  ATGTGCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACT  776

Query  831  GTACCAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTG  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  GTACCAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTG  850

Query  905  CCCGGAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTC  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  CCCGGAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTC  924

Query  979  TTGGGCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGG  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  TTGGGCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGG  998

Query 1053  AGTTCGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGG  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  AGTTCGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGG  1072

Query 1127  AA  1128
            ||
Sbjct 1073  AA  1074