Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03749
• Subject: XM_011529664.2
• Aligned Length: 1252
• Identities: 1016
• Gaps: 236

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTTTCACGCTCCCACAGTGGCTCCTGCACCTTCAGACACTGCCTCCTCACCGAGGGAGGGAAGAACGACAA  74

Query    1  --------------------------------------------------ATGGGCCTGCTGGCCTTCCTGAAG  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGACGGCTGTCCTCAGCGAGGGGCCGTGCACCCGCTCCTGAGCAGCGCCATGGGCCTGCTGGCCTTCCTGAAG  148

Query   25  ACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGGTCTGGTCATCAACTTCGTCCAGCT  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  149  ACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTG--------------------------------  190

Query   99  GTGCACGCTGGCGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCAACTGCCGCCTCGCCTACTCACTCT  172
                                                                                      
Sbjct  191  --------------------------------------------------------------------------  190

Query  173  GGAGCCAACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCACGGTA  246
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  ------AACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCACGGTA  258

Query  247  GAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGTGGAC  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGTGGAC  332

Query  321  CATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCA  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  CATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCA  406

Query  395  TCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGTGGTC  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  TCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGTGGTC  480

Query  469  GAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCTTCAC  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCTTCAC  554

Query  543  GGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGC  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGC  628

Query  617  CGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAACCCTG  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  CGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAACCCTG  702

Query  691  AACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGTGCGT  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  AACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGTGCGT  776

Query  765  GAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTACCAGG  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  GAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTACCAGG  850

Query  839  AGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGG  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  AGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGG  924

Query  913  CCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGT  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  CCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGT  998

Query  987  CTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCA  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  CTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCA  1072

Query 1061  GACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  GACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1140