Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03749
Subject:
XM_017028411.1
Aligned Length:
1128
Identities:
942
Gaps:
186

Alignment

Query    1  ATGGGCCTGCTGGCCTTCCTGAAGACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCTGGTCATCAACTTCGTCCAGCTGTGCACGCTGGCGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTGCCGCCTCGCCTACTCACTCTGGAGCCAACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACA  222
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------ATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACA  36

Query  223  CTGTTCACGGACCAGGCCACGGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   37  CTGTTCACGGACCAGGCCACGGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGA  110

Query  297  GATCGACTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  111  GATCGACTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGA  184

Query  371  AGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  AGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGG  258

Query  445  GAGGAGGACCGGGACACCGTGGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GAGGAGGACCGGGACACCGTGGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCT  332

Query  519  GTACTGCGAGGGGACGCGCTTCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  GTACTGCGAGGGGACGCGCTTCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTC  406

Query  593  CTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  CTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTC  480

Query  667  GCAGCTGTCTATGATGTAACCCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GCAGCTGTCTATGATGTAACCCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAA  554

Query  741  GAAGTACGAGGCGGACATGTGCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GAAGTACGAGGCGGACATGTGCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTC  628

Query  815  AGTGGCTTCATAAACTGTACCAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  AGTGGCTTCATAAACTGTACCAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGG  702

Query  889  GAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  GAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCC  776

Query  963  CCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  CCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGG  850

Query 1037  GAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  GAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAA  924

Query 1111  GAGTTTAAGAAAAAGGAA  1128
            ||||||||||||||||||
Sbjct  925  GAGTTTAAGAAAAAGGAA  942