Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03756
• Subject: NM_001276717.1
• Aligned Length: 2043
• Identities: 2043
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTCCGCAAGAAAAAGAAGAAACGCCCTGAGATCTCAGCGCCACAGAACTTCCAGCACCGTGTCCACACCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCCGCAAGAAAAAGAAGAAACGCCCTGAGATCTCAGCGCCACAGAACTTCCAGCACCGTGTCCACACCTC  74

Query   75  CTTCGACCCCAAAGAAGGCAAGTTTGTGGGCCTCCCCCCACAATGGCAGAACATCCTGGACACACTGCGGCGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCGACCCCAAAGAAGGCAAGTTTGTGGGCCTCCCCCCACAATGGCAGAACATCCTGGACACACTGCGGCGCC  148

Query  149  CCAAGCCCGTGGTGGACCCTTCGCGAATCACACGGGTGCAGCTCCAGCCCATGAAGACAGTGGTGCGGGGCAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAGCCCGTGGTGGACCCTTCGCGAATCACACGGGTGCAGCTCCAGCCCATGAAGACAGTGGTGCGGGGCAGC  222

Query  223  GCGATGCCTGTGGATGGCTACATCTCGGGGCTGCTCAACGACATCCAGAAGTTGTCAGTCATCAGCTCCAACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGATGCCTGTGGATGGCTACATCTCGGGGCTGCTCAACGACATCCAGAAGTTGTCAGTCATCAGCTCCAACAC  296

Query  297  CCTGCGTGGCCGCAGCCCCACCAGCCGGCGGCGGGCACAGTCCCTGGGGCTGCTGGGGGATGAGCACTGGGCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGCGTGGCCGCAGCCCCACCAGCCGGCGGCGGGCACAGTCCCTGGGGCTGCTGGGGGATGAGCACTGGGCCA  370

Query  371  CCGACCCAGACATGTACCTCCAGAGCCCCCAGTCTGAGCGCACTGACCCCCACGGCCTCTACCTCAGCTGCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGACCCAGACATGTACCTCCAGAGCCCCCAGTCTGAGCGCACTGACCCCCACGGCCTCTACCTCAGCTGCAAC  444

Query  445  GGGGGCACACCAGCAGGCCACAAGCAGATGCCGTGGCCCGAGCCACAGAGCCCACGGGTCCTGCCCAATGGGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGGCACACCAGCAGGCCACAAGCAGATGCCGTGGCCCGAGCCACAGAGCCCACGGGTCCTGCCCAATGGGCT  518

Query  519  GGCTGCAAAGGCACAGTCCCTGGGCCCCGCCGAGTTTCAGGGTGCCTCGCAGCGCTGTCTGCAGCTGGGTGCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTGCAAAGGCACAGTCCCTGGGCCCCGCCGAGTTTCAGGGTGCCTCGCAGCGCTGTCTGCAGCTGGGTGCCT  592

Query  593  GCCTGCAGAGCTCCCCACCAGGAGCCTCGCCCCCCACGGGCACCAATAGGCATGGAATGAAGGCTGCCAAGCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTGCAGAGCTCCCCACCAGGAGCCTCGCCCCCCACGGGCACCAATAGGCATGGAATGAAGGCTGCCAAGCAT  666

Query  667  GGCTCTGAGGAGGCCCGGCCACAGTCCTGCCTGGTGGGCTCAGCCACAGGCAGGCCAGGTGGGGAAGGCAGCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTCTGAGGAGGCCCGGCCACAGTCCTGCCTGGTGGGCTCAGCCACAGGCAGGCCAGGTGGGGAAGGCAGCCC  740

Query  741  TAGCCCTAAGACCCGGGAGAGCAGCCTGAAGCGCAGGCTATTCCGAAGCATGTTCCTGTCCACTGCTGCCACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGCCCTAAGACCCGGGAGAGCAGCCTGAAGCGCAGGCTATTCCGAAGCATGTTCCTGTCCACTGCTGCCACAG  814

Query  815  CCCCTCCAAGCAGCAGCAAGCCAGGCCCTCCACCACAGAGCAAGCCCAACTCCTCTTTCCGACCGCCGCAGAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCTCCAAGCAGCAGCAAGCCAGGCCCTCCACCACAGAGCAAGCCCAACTCCTCTTTCCGACCGCCGCAGAAA  888

Query  889  GACAACCCCCCAAGCCTGGTGGCCAAGGCCCAGTCCTTGCCCTCGGACCAGCCGGTGGGGACCTTCAGCCCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAACCCCCCAAGCCTGGTGGCCAAGGCCCAGTCCTTGCCCTCGGACCAGCCGGTGGGGACCTTCAGCCCTCT  962

Query  963  GACCACTTCGGATACCAGCAGCCCCCAGAAGTCCCTCCGCACAGCCCCGGCCACAGGCCAGCTTCCAGGCCGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACCACTTCGGATACCAGCAGCCCCCAGAAGTCCCTCCGCACAGCCCCGGCCACAGGCCAGCTTCCAGGCCGGT  1036

Query 1037  CTTCCCCAGCGGGATCCCCCCGCACCTGGCACGCCCAGATCAGCACCAGCAACCTGTACCTGCCCCAGGACCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTCCCCAGCGGGATCCCCCCGCACCTGGCACGCCCAGATCAGCACCAGCAACCTGTACCTGCCCCAGGACCCC  1110

Query 1111  ACGGTTGCCAAGGGTGCCCTGGCTGGTGAGGACACAGGTGTTGTGACACATGAGCAGTTCAAGGCTGCGCTCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGTTGCCAAGGGTGCCCTGGCTGGTGAGGACACAGGTGTTGTGACACATGAGCAGTTCAAGGCTGCGCTCAG  1184

Query 1185  GATGGTGGTGGACCAGGGTGACCCCCGGCTGCTGCTGGACAGCTACGTGAAGATTGGCGAGGGCTCCACCGGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATGGTGGTGGACCAGGGTGACCCCCGGCTGCTGCTGGACAGCTACGTGAAGATTGGCGAGGGCTCCACCGGCA  1258

Query 1259  TCGTCTGCTTGGCCCGGGAGAAGCACTCGGGCCGCCAGGTGGCCGTCAAGATGATGGACCTCAGGAAGCAGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGTCTGCTTGGCCCGGGAGAAGCACTCGGGCCGCCAGGTGGCCGTCAAGATGATGGACCTCAGGAAGCAGCAG  1332

Query 1333  CGCAGGGAGCTGCTCTTCAACGAGGTGGTGATCATGCGGGACTACCAGCACTTCAACGTGGTGGAGATGTACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCAGGGAGCTGCTCTTCAACGAGGTGGTGATCATGCGGGACTACCAGCACTTCAACGTGGTGGAGATGTACAA  1406

Query 1407  GAGCTACCTGGTGGGCGAGGAGCTGTGGGTGCTCATGGAGTTCCTGCAGGGAGGAGCCCTCACAGACATCGTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCTACCTGGTGGGCGAGGAGCTGTGGGTGCTCATGGAGTTCCTGCAGGGAGGAGCCCTCACAGACATCGTCT  1480

Query 1481  CCCAAGTCAGGCTGAATGAGGAGCAGATTGCCACTGTGTGTGAGGCTGTGCTGCAGGCCCTGGCCTACCTGCAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAAGTCAGGCTGAATGAGGAGCAGATTGCCACTGTGTGTGAGGCTGTGCTGCAGGCCCTGGCCTACCTGCAT  1554

Query 1555  GCTCAGGGTGTCATCCACCGGGACATCAAGAGTGACTCCATCCTGCTGACCCTCGATGGCAGGGTGAAGCTCTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTCAGGGTGTCATCCACCGGGACATCAAGAGTGACTCCATCCTGCTGACCCTCGATGGCAGGGTGAAGCTCTC  1628

Query 1629  GGACTTCGGATTCTGTGCTCAGATCAGCAAAGACGTCCCTAAGAGGAAGTCCCTGGTGGGAACCCCCTACTGGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGACTTCGGATTCTGTGCTCAGATCAGCAAAGACGTCCCTAAGAGGAAGTCCCTGGTGGGAACCCCCTACTGGA  1702

Query 1703  TGGCTCCTGAAGTGATCTCCAGGTCTTTGTATGCCACTGAGGTGGATATCTGGTCTCTGGGCATCATGGTGATT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGCTCCTGAAGTGATCTCCAGGTCTTTGTATGCCACTGAGGTGGATATCTGGTCTCTGGGCATCATGGTGATT  1776

Query 1777  GAGATGGTAGATGGGGAGCCACCGTACTTCAGTGACTCCCCAGTGCAAGCCATGAAGAGGCTCCGGGACAGCCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGATGGTAGATGGGGAGCCACCGTACTTCAGTGACTCCCCAGTGCAAGCCATGAAGAGGCTCCGGGACAGCCC  1850

Query 1851  CCCACCCAAGCTGAAAAACTCTCACAAGGTCTCCCCAGTGCTGCGAGACTTCCTGGAGCGGATGCTGGTGCGGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCACCCAAGCTGAAAAACTCTCACAAGGTCTCCCCAGTGCTGCGAGACTTCCTGGAGCGGATGCTGGTGCGGG  1924

Query 1925  ACCCCCAAGAGAGAGCCACAGCCCAGGAGCTCCTAGACCACCCCTTCCTGCTGCAGACAGGGCTACCTGAGTGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCCCCAAGAGAGAGCCACAGCCCAGGAGCTCCTAGACCACCCCTTCCTGCTGCAGACAGGGCTACCTGAGTGC  1998

Query 1999  CTGGTGCCCCTGATCCAGCTCTACCGAAAGCAGACCTCCACCTGC  2043
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGGTGCCCCTGATCCAGCTCTACCGAAAGCAGACCTCCACCTGC  2043