Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03757
Subject:
NM_028296.3
Aligned Length:
984
Identities:
930
Gaps:
0

Alignment

Query   1  ATGGAAATAGTCTGGGAGGTGCTTTTTCTTCTTCAAGCCAATTTCATCGTCTGCATATCAGCTCAACAGAATTC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAAATAGTCTGGGAGGTGCTTTTTCTTCTTCAAGCCAATTTCATCGTCTGCATATCAGCTCAACAGAATTC  74

Query  75  ACCAAAAATCCATGAAGGCTGGTGGGCATACAAGGAGGTGGTCCAGGGAAGCTTTGTTCCAGTTCCTTCTTTCT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACCAAAAATCCATGAAGGCTGGTGGGCATACAAGGAGGTGGTCCAGGGAAGCTTTGTTCCAGTTCCTTCTTTCT  148

Query 149  GGGGATTGGTGAACTCAGCTTGGAATCTTTGCTCTGTGGGGAAACGGCAGTCGCCAGTCAACATAGAGACCAGT  222
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 149  GGGGATTGGTGAACTCAGCTTGGAATCTTTGCTCTGTGGGGAAGCGTCAGTCCCCTGTCAACATAGAAACCAGT  222

Query 223  CACATGATCTTCGACCCCTTTCTGACACCTCTTCGCATCAACACGGGGGGCAGGAAGGTCAGTGGGACCATGTA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CACATGATCTTCGACCCCTTTCTGACACCTCTTCGCATCAACACTGGGGGCAGGAAGGTCAGTGGGACCATGTA  296

Query 297  CAACACTGGAAGACACGTATCCCTTCGCCTGGACAAGGAGCACTTGGTCAACATATCTGGAGGGCCCATGACAT  370
           ||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 297  CAACACTGGAAGGCATGTCTCCCTCCGCCTGGACAAAGAGCACTTGGTCAATATTTCAGGAGGGCCCATGACAT  370

Query 371  ACAGCCACCGGCTGGAGGAGATCCGACTACACTTTGGGAGTGAGGACAGCCAAGGGTCGGAGCACCTCCTCAAT  444
           ||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371  ACAGTCACCGCCTGGAAGAAATCCGGCTACACTTTGGGAGTGAGGACAGCCAAGGGTCTGAGCACCTCCTCAAT  444

Query 445  GGACAGGCCTTCTCTGGGGAGGTGCAGCTCATCCACTATAACCATGAGCTATATACGAATGTCACAGAAGCTGC  518
           ||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445  GGACAGGCCTTCTCCGGGGAGGTACAACTCATCCACTATAACCACGAGCTATACACAAATGTCACAGAAGCTGC  518

Query 519  AAAGAGTCCAAATGGATTGGTGGTAGTTTCTATATTTATAAAAGTTTCTGATTCATCAAACCCATTTCTTAATC  592
           .|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GAAGAGCCCGAATGGATTGGTGGTAGTTTCTATATTTATAAAAGTTTCTGATTCATCAAACCCATTTCTTAATC  592

Query 593  GAATGCTCAACAGAGATACTATCACAAGAATAACATATAAAAATGATGCATATTTACTACAGGGGCTTAATATA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 593  GAATGCTCAACAGAGATACTATCACAAGAATAACATATAAAAATGATGCATACTTACTACAGGGACTTAATATA  666

Query 667  GAGGAACTATATCCAGAGACCTCTAGTTTCATCACTTACGATGGGTCGATGACTATCCCACCCTGCTATGAGAC  740
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667  GAGGAACTGTATCCAGAGACCTCTAGTTTCATCACTTATGATGGGTCGATGACTATCCCGCCCTGCTATGAGAC  740

Query 741  AGCAAGTTGGATCATAATGAACAAACCTGTCTATATAACCAGGATGCAGATGCATTCCTTGCGCCTGCTCAGCC  814
           ||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 741  AGCAAGTTGGATAATAATGAACAAGCCTGTGTACATAACCAGGATGCAGATGCATTCCCTACGCCTCCTCAGCC  814

Query 815  AGAACCAGCCATCTCAGATCTTTCTGAGCATGAGTGACAACTTCAGGCCTGTCCAGCCACTCAACAACCGCTGC  888
           ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 815  AGAATCAGCCATCGCAGATCTTTCTGAGCATGAGTGACAACTTCAGGCCTGTCCAGCCACTCAATAATCGCTGT  888

Query 889  ATCCGCACCAATATCAACTTCAGTTTACAGGGGAAGGACTGTCCAAACAACCGAGCCCAGAAGCTTCAGTATAG  962
           ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 889  ATTCGCACCAACATCAACTTCAGTTTACAGGGGAAGGACTGTCCTAACAACAGGGCCCAGAAGCTACAGTACAG  962

Query 963  AGTAAATGAATGGCTCCTCAAG  984
           ||||||.|||||||||||||||
Sbjct 963  AGTAAACGAATGGCTCCTCAAG  984