Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03778
• Subject: NM_001349962.2
• Aligned Length: 1819
• Identities: 1811
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATG-------GCTAGGATCAGTTTTTCCTACCTCTGCCCAGCCTCCTGGTACTTCACTGTGCCCACAGTGAGTC  67
            |||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGAACAGC-AGGATCAGTTTTTCCTACCTCTGCCCAGCCTCCTGGTACTTCACTGTGCCCACAGTGAGTC  73

Query   68  CATTTCTCCGTCAGCGGGTGGCATTCCTGGGACTCTTCTTCATATCCTGTCTCCTTTTACTTATGTTAATCATA  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CATTTCTCCGTCAGCGGGTGGCATTCCTGGGACTCTTCTTCATATCCTGTCTCCTTTTACTTATGTTAATCATA  147

Query  142  GACTTTCGACATTGGAGTGCTTCATTACCACGAGATAGGCAATACGAAAGGTATTTGGCTCGAGTAGGGGAGCT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GACTTTCGACATTGGAGTGCTTCATTACCACGAGATAGGCAATACGAAAGGTATTTGGCTCGAGTAGGGGAGCT  221

Query  216  TGAAGCTACTGACACTGAAGACCCAAATCTGAATTATGGACTTGTTGTTGACTGTGGCAGCAGTGGTTCCCGGA  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TGAAGCTACTGACACTGAAGACCCAAATCTGAATTATGGACTTGTTGTTGACTGTGGCAGCAGTGGTTCCCGGA  295

Query  290  TTTTTGTTTATTTCTGGCCAAGACATAATGGGAACCCCCATGACTTGCTGGACATCAAACAGATGAGAGACCGC  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TTTTTGTTTATTTCTGGCCAAGACATAATGGGAACCCCCATGACTTGCTGGACATCAAACAGATGAGAGACCGC  369

Query  364  AACAGCCAACCAGTGGTTAAAAAAATCAAGCCAGGAATCTCTGCAATGGCAGACACTCCAGAACATGCCAGTGA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  AACAGCCAACCAGTGGTTAAAAAAATCAAGCCAGGAATCTCTGCAATGGCAGACACTCCAGAACATGCCAGTGA  443

Query  438  TTACCTTCGTCCTCTGCTGAGCTTTGCTGCTGCTCATGTGCCTGTGAAGAAGCACAAGGAGACCCCTCTTTACA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TTACCTTCGTCCTCTGCTGAGCTTTGCTGCTGCTCATGTGCCTGTGAAGAAGCACAAGGAGACCCCTCTTTACA  517

Query  512  TCCTCTGCACAGCAGGCATGAGGCTTCTCCCTGAGAGGAAGCAGTTGGCTATCTTGGCTGACCTAGTGAAAGAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TCCTCTGCACAGCAGGCATGAGGCTTCTCCCTGAGAGGAAGCAGTTGGCTATCTTGGCTGACCTAGTGAAAGAT  591

Query  586  TTACCACTGGAGTTTGACTTCCTCTTTTCACAGTCTCAAGCAGAAGTGATCTCTGGGAAGCAGGAAGGGGTTTA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  TTACCACTGGAGTTTGACTTCCTCTTTTCACAGTCTCAAGCAGAAGTGATCTCTGGGAAGCAGGAAGGGGTTTA  665

Query  660  TGCATGGATTGGAATCAACTTTGTTTTGGGAAGATTCGACCACGAGGATGAATCAGATGCTGAGGCTACCCAGG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TGCATGGATTGGAATCAACTTTGTTTTGGGAAGATTCGACCACGAGGATGAATCAGATGCTGAGGCTACCCAGG  739

Query  734  AATTGGCAGCAGGACGGAGAAGGACAGTAGGGATACTGGATATGGGAGGAGCCTCTCTCCAAATTGCTTATGAA  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AATTGGCAGCAGGACGGAGAAGGACAGTAGGGATACTGGATATGGGAGGAGCCTCTCTCCAAATTGCTTATGAA  813

Query  808  GTTCCTACCTCAACCTCTGTCCTTCCTGCAAAGCAGGAAGAAGCTGCCAAGATCCTGCTGGCTGAGTTCAACCT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GTTCCTACCTCAACCTCTGTCCTTCCTGCAAAGCAGGAAGAAGCTGCCAAGATCCTGCTGGCTGAGTTCAACCT  887

Query  882  GGGCTGTGATGTGCAACACACTGAACACGTGTACAGGGTTTATGTCACAACTTTTCTGGGTTTCGGAGGCAACT  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGGCTGTGATGTGCAACACACTGAACACGTGTACAGGGTTTATGTCACAACTTTTCTGGGTTTCGGAGGCAACT  961

Query  956  TTGCCCGGCAGCGCTACGAAGACCTTGTTCTGAATGAAACTCTTAACAAAAACAGATTGCTTGGTCAGAAGACA  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TTGCCCGGCAGCGCTACGAAGACCTTGTTCTGAATGAAACTCTTAACAAAAACAGATTGCTTGGTCAGAAGACA  1035

Query 1030  GGTCTGAGTCCCGACAATCCATTTCTGGATCCCTGCCTGCCAGTGGGACTCACAGATGTGGTGGAGAGGAACAG  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGTCTGAGTCCCGACAATCCATTTCTGGATCCCTGCCTGCCAGTGGGACTCACAGATGTGGTGGAGAGGAACAG  1109

Query 1104  CCAAGTCTTACATGTCCGAGGAAGAGGAGACTGGGTGTCTTGTGGGGCAATGCTGAGCCCCCTGCTGGCTCGCT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CCAAGTCTTACATGTCCGAGGAAGAGGAGACTGGGTGTCTTGTGGGGCAATGCTGAGCCCCCTGCTGGCTCGCT  1183

Query 1178  CCAACACCAGCCAGGCCTCACTCAATGGCATATATCAATCGCCTATTGACTTCAACAACAGCGAGTTCTACGGC  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  CCAACACCAGCCAGGCCTCACTCAATGGCATATATCAATCGCCTATTGACTTCAACAACAGCGAGTTCTACGGC  1257

Query 1252  TTCTCTGAGTTTTTTTATTGTACAGAGGATGTGTTGCGCATTGGTGGCCGCTACCATGGGCCAACATTTGCCAA  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  TTCTCTGAGTTTTTTTATTGTACAGAGGATGTGTTGCGCATTGGTGGCCGCTACCATGGGCCAACATTTGCCAA  1331

Query 1326  GGCTGCTCAGGATTACTGTGGCATGGCTTGGTCGGTACTAACTCAGAGATTCAAGAATGGCCTCTTTTCATCAC  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GGCTGCTCAGGATTACTGTGGCATGGCTTGGTCGGTACTAACTCAGAGATTCAAGAATGGCCTCTTTTCATCAC  1405

Query 1400  ATGCAGATGAGCATCGACTCAAATATCAGTGTTTTAAATCGGCTTGGATGTACCAAGTCTTACATGAAGGATTC  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  ATGCAGATGAGCATCGACTCAAATATCAGTGTTTTAAATCGGCTTGGATGTACCAAGTCTTACATGAAGGATTC  1479

Query 1474  CACTTTCCCTATGACTACCCAAACCTGCGGACAGCCCAGCTGGTGTATGACCGAGAGGTTCAGTGGACGCTGGG  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CACTTTCCCTATGACTACCCAAACCTGCGGACAGCCCAGCTGGTGTATGACCGAGAGGTTCAGTGGACGCTGGG  1553

Query 1548  AGCCATTCTATATAAAACACGATTCTTACCACTCAGGGATCTTCGGCAGGAAGGTGTCCGACAAGCCCATGGTA  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AGCCATTCTATATAAAACACGATTCTTACCACTCAGGGATCTTCGGCAGGAAGGTGTCCGACAAGCCCATGGTA  1627

Query 1622  GCTGGTTCCGTCTCTCCTTTGTATACAACCACTATCTCTTCTTTGCCTGTATCCTGGTGGTGCTACTGGCCATC  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  GCTGGTTCCGTCTCTCCTTTGTATACAACCACTATCTCTTCTTTGCCTGTATCCTGGTGGTGCTACTGGCCATC  1701

Query 1696  TTCCTATACCTTCTGCGGCTACGCCGAATTCACCACCGACAAACACGAGCCTCAGCTCCATTGGACTTGCTGTG  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  TTCCTATACCTTCTGCGGCTACGCCGAATTCACCACCGACAAACACGAGCCTCAGCTCCATTGGACTTGCTGTG  1775

Query 1770  GCTTGAAGAGGTGGTGCCCATGATGGGAGTACAGGTGGGGCCG  1812
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  GCTTGAAGAGGTGGTGCCCATGATGGGAGTACAGGTGGGGCCG  1818