Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03798
- Subject:
- NM_001127357.2
- Aligned Length:
- 2253
- Identities:
- 2253
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA 74
Query 75 AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG 148
Query 149 TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG 222
Query 223 ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC 296
Query 297 ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA 370
Query 371 CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG 444
Query 445 CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG 518
Query 519 AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG 592
Query 593 TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT 666
Query 667 TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA 740
Query 741 TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG 814
Query 815 AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC 888
Query 889 TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA 962
Query 963 AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA 1036
Query 1037 CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT 1110
Query 1111 GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA 1184
Query 1185 TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA 1258
Query 1259 GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT 1332
Query 1333 GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG 1406
Query 1407 AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC 1480
Query 1481 TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG 1554
Query 1555 GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC 1628
Query 1629 TTATAAACAGCGATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATCTGAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTATAAACAGCGATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATCTGAGG 1702
Query 1703 TTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGCGTCGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGCGTCGA 1776
Query 1777 GGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATCTGTTG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATCTGTTG 1850
Query 1851 TGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTGCATCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTGCATCT 1924
Query 1925 CGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCTCAATA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCTCAATA 1998
Query 1999 TTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACACTAGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACACTAGT 2072
Query 2073 GAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCTTACAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCTTACAA 2146
Query 2147 TGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACTTGCTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACTTGCTT 2220
Query 2221 GGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA 2253
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA 2253