Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03798
Subject:
NM_001366084.1
Aligned Length:
751
Identities:
703
Gaps:
48

Alignment

Query   1  MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIKFIKLGLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSAFAKAKPESPW  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIK----GLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSAFAKAKPESPW  70

Query  75  TSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  71  TSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTV  144

Query 149  HCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEVHREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145  HCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEVHREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFF  218

Query 223  LSGSKKAKNSIDKSTETDNGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNTGTLRNGPSKDTQRTITNV  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219  LSGSKKAKNSIDKSTETDNGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNTGTLRNGPSKDTQRTITNV  292

Query 297  SDEVSSEEGPETGYSLRRHVDRTSEGVLRNRKSHHYKKHYPNEDAPKSGTSCSSRCSSSRQDSESARPESETED  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293  SDEVSSEEGPETGYSLRRHVDRTSEGVLRNRKSHHYKKHYPNEDAPKSGTSCSSRCSSSRQDSESARPESETED  366

Query 371  VLWEDLLHCAECHSSCTSETDVENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKADMS  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367  VLWEDLLHCAECHSSCTSETDVENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKADMS  440

Query 445  VLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASELYVIAFGSNEDVIVLSM  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  VLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASELYVIAFGSNEDVIVLSM  514

Query 519  VIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLTSARRARKSEVPHFRLKKVQNIKMWLSLRSYLKRR  592
           ||||||||||||||||||||||||||||                                            ||
Sbjct 515  VIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQ--------------------------------------------RR  544

Query 593  GPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCAQLLHVHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545  GPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCAQLLHVHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSI  618

Query 667  LLTEQINLYLKMEKKPNKKEELTLVNNVLKLATKLLKELDSPFRLYGLTMNPLLYNITQVVILSAVSGVISDLL  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619  LLTEQINLYLKMEKKPNKKEELTLVNNVLKLATKLLKELDSPFRLYGLTMNPLLYNITQVVILSAVSGVISDLL  692

Query 741  GFNLKLWKIKS  751
           |||||||||||
Sbjct 693  GFNLKLWKIKS  703