Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03798
• Subject: NM_001366085.2
• Aligned Length: 751
• Identities: 469
• Gaps: 278

Alignment

Query   1  MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIKFIKLGLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSAFAKAKPESPW  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MASKVTDAIVWYQKKIGAYDQQIWEKSVEQREIK----GLRNKPKKTAHVKPDLIDVDLVRGSAFAKAKPESPW  70

Query  75  TSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  71  TSLTRKGIVRVVFFPFFFRWWLQVTSKVIFFWLLVLYLLQVAAIVLFCSTSSPHSIPLTEVIGPIWLMLLLGTV  144

Query 149  HCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEVHREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145  HCQIVSTRTPKPPLSTGGKRRRKLRKAAHLEVHREGDGSSTTDNTQEGAVQNHGTSTSHSVGTVFRDLWHAAFF  218

Query 223  LSGSKKAKNSIDKSTETDNGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNTGTLRNGPSKDTQRTITNV  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219  LSGSKKAKNSIDKSTETDNGYVSLDGKKTVKSGEDGIQNHEPQCETIRPEETAWNTGTLRNGPSKDTQRTITNV  292

Query 297  SDEVSSEEGPETGYSLRRHVDRTSEGVLRNRKSHHYKKHYPNEDAPKSGTSCSSRCSSSRQDSESARPESETED  370
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 293  SDEVSSEEGPETGYSLRRHVDRTSEGVLRNRKSHHYKKHYPNE-------------------------------  335

Query 371  VLWEDLLHCAECHSSCTSETDVENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKADMS  444
                                                     ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336  ------------------------------------------SHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKADMS  367

Query 445  VLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASELYVIAFGSNEDVIVLSM  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368  VLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASELYVIAFGSNEDVIVLSM  441

Query 519  VIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLTSARRARKSEVPHFRLKKVQNIKMWLSLRSYLKRR  592
           ||||||||||||||||||||||||||||....                                          
Sbjct 442  VIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQVGIM------------------------------------------  473

Query 593  GPQRSVDVIVSSAFLLTISVVFICCAQLLHVHEIFLDCHYNWELVIWCISLTLFLLRFVTLGSETSKKYSNTSI  666
                                                                                     
Sbjct 474  --------------------------------------------------------------------------  473

Query 667  LLTEQINLYLKMEKKPNKKEELTLVNNVLKLATKLLKELDSPFRLYGLTMNPLLYNITQVVILSAVSGVISDLL  740
                                                                                     
Sbjct 474  --------------------------------------------------------------------------  473

Query 741  GFNLKLWKIKS  751
                      
Sbjct 474  -----------  473