Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03829
- Subject:
- XM_006534062.3
- Aligned Length:
- 2088
- Identities:
- 1955
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCATCCCCAGCA 74
Query 75 GCAGCAGCAGCAGC---CGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACC 145
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAGCAGCAGCAGCAGTCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACC 148
Query 146 ATCATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTG 219
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 ACCATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCCAAGCCGCTG 222
Query 220 AAACATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAA 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 223 AAACATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAAATAAA 296
Query 294 CGGTAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGG 367
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGGTAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAGCCTCAGTTCTGATGAAGCTACCAACCCTATTTCCAGGG 370
Query 368 TCCTCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCA 441
||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||
Sbjct 371 TCCTTAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGAAACAAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGACCAGCACCTTTGGAAAAGCA 444
Query 442 GGAATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATC 515
|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 GGAATCAAAACCAAGAATTTTATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAACAAATC 518
Query 516 TGGAGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTT 589
||||||||..|||.|||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||||||||..||||||.||.|||.||.|
Sbjct 519 TGGAGAGACCCAGGCTGTAGATAAGACCGATACCATAGCAATTCCAAATGGTGTTATAACAAGTAGTTCAGGCT 592
Query 590 ATATTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCT 663
||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 ATATTACTAATGGTTATATGAGCAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGTGGATATACCACTCCT 666
Query 664 AAAAAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCA 737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAAAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATTTAGTGCAGGACAAAATAATG-- 738
Query 738 ACAAGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAA 811
||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 -CAAGAGACTAGTGTCCCAGCATTAAAACAGGGACTTGAAACTTTAAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAA 811
Query 812 ATCGAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCT 885
..||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 812 TGCGAGTAGATGGTTCAAAGCCTATTTGGAAATATGAAACTGGACCTGGAGGAACAAGTCGTGGAAAACCTGCT 885
Query 886 GTGGGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAA 959
.|||||||..|||||||.||||||||.||||.||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 886 ATGGGTGACGTGCTTCGTAAAAGCTCTGATATTAAACCTGGTTTGAGTAGCAAAAAATTTGATGATCGGCCTAA 959
Query 960 AGGAAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAG 1033
||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 960 AGGAAAGCATGCCTCAGCTGCTGCCTCCAAAGAGGACTCATGGACCTTGTTTAAGCCACCCCCAGTTTTTCCAG 1033
Query 1034 TGGACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACT 1107
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TGGACAATAGCAGTGCAAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACT 1107
Query 1108 ATACAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATC 1181
.||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||| |||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1108 GTACAGAACTCCTCCGTGTCACCATCTTCATCTTCATCA---TCATCATCTACTGGGGAAACTCAGACCCAGTC 1178
Query 1182 ATCAAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTG 1255
.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1179 TTCAAGTCGGTTATCCCAGGTCCCGATGTCAGCTCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAGTTTTTCTAATGGGCCTG 1252
Query 1256 TTTTAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTA 1329
||||||||||.||||||||||.|||.||.||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1253 TTTTAGCAGGAACTGATGGAAGTGTGTACCCATCTGGGGGTCAGCCACTGCTAACGACTGCTGCTAATACTTTA 1326
Query 1330 ACACCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAA 1403
||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1327 ACACCCATCTCTACTGGGACTGATTCTGTTCTTCAGGACATGAGTCTGGCTTCAGCAGCCGTTGAACAAATTAA 1400
Query 1404 GACTAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTC 1477
..||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|| .||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1401 ATCTAGCCTTTTTATCTACCCTTCAAATATGCAAACAGTGCTGTTAAG---TGCACAAGTAGATCTGCCCTCTC 1471
Query 1478 AGACAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCT 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 AGACAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAATGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCT 1545
Query 1552 GGCCCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGC 1625
|||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 GGCCCAGAGACTGTTATTGGAAAGTCATCAGATCATAAAGTGATGGAAGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGC 1619
Query 1626 TACTTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGC 1699
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1620 CACTTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTATGAGC 1693
Query 1700 TGGAGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTA 1773
||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1694 TGGAAAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTCACATTCTAAAACCTGGGACTAC---TGAGAGTGGAGCCTTA 1764
Query 1774 TCCTTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTC 1847
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 TCCTTGGACCCCAGTCATATAGGTGACCTGCAAAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTC 1838
Query 1848 AAAGGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAAC 1921
||||||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1839 AAAGGACTACGAAATAGAAAATCAAAATCCCCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCCGCCAAAGAAC 1912
Query 1922 AGAGATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCAC 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 AGAGATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCAC 1986
Query 1996 ACTAAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCAT 2069
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 ACTAAAGAAATGGAATCTATATGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCAT 2060
Query 2070 GGATAGTCCAGATCAA 2085
||||||||||||||||
Sbjct 2061 GGATAGTCCAGATCAA 2076