Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03838
• Subject: NM_001113416.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1339
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCTGAGTTTCTTCCGTAGAACACTAGGGCGTCGGTCTATGCGTAAACATGCAGAGAAGGAACGACTCCGAGA  74
            ||||||||.|||.|..|..||||.||.||.||..||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGCTTCCTGAGACGAACGCTTGGCCGCAGGTCTATGCGCAAGCATGCTGAAAAGGAGCGGCTCCGAGA  74

Query   75  AGCACAACGCGCCGCCACACATATTCCTGCAGCTGGAGATTCTAAGTCCATCATCACGTGTCGGGTGTCCCTTC  148
            .|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||||.||..||||||||||||
Sbjct   75  GGCACAGCGTGCGGCCACACACATTCCTGCCGCTGGGGATGCCAAGTCCATCATCACATGCAGGGTGTCCCTTC  148

Query  149  TGGATGGTACTGATGTTAGTGTGGACTTGCCAAAAAAAGCCAAAGGACAAGAGTTGTTTGATCAGATTATGTAC  222
            ||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||.||.||.|||||.
Sbjct  149  TGGACGGTACAGATGTCAGTGTGGACTTGCCGAAAAAAGCCAAAGGACAGGAGCTGTTTGACCAAATCATGTAT  222

Query  223  CACCTGGACCTGATTGAAAGCGACTATTTTGGTCTGAGATTTATGGATTCAGCACAAGTAGCACATTGGTTGGA  296
            |||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CACCTGGACTTGATTGAAAGTGACTATTTTGGTTTGAGATTCATGGATTCAGCCCAAGTAGCCCATTGGTTGGA  296

Query  297  TGGTACAAAAAGCATCAAAAAGCAAGTAAAAATTGGTTCACCCTATTGTCTGCATCTTCGAGTTAAGTTTTATT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGTACAAAAAGCATCAAAAAGCAAGTAAAAATTGGTTCACCCTATTGTCTTCATCTTCGAGTTAAGTTTTATT  370

Query  371  CCTCAGAACCAAATAACCTTCGTGAGGAGCTAACCCGGTATTTATTTGTTCTTCAGTTAAAACAAGATATTCTC  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCGGAACCAAATAATCTTCGTGAGGAGCTAACCCGGTATTTATTTGTTCTTCAGCTAAAACAAGATATTCTC  444

Query  445  AGTGGAAAATTAGACTGTCCCTTTGATACAGCAGTGCAATTGGCAGCTTATAATCTGCAAGCTGAACTTGGTGA  518
            |||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  AGTGGGAAGTTAGAGTGTCCCTTTGATACAGCAGTTCAGTTGGCAGCTTATAATCTGCAAGCTGAACTTGGCGA  518

Query  519  CTATGATCTTGCTGAGCATAGTCCTGAACTTGTCTCAGAGTTCAGATTCGTGCCTATTCAGACTGAAGAGATGG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGATCTTGCTGAACATAGTCCTGAACTGGTCTCTGAGTTCAGGTTTGTGCCCATCCAGACTGAAGAGATGG  592

Query  593  AACTGGCTATTTTTGAGAAATGGAAGGAATACAGAGGTCAAACACCAGCACAGGCTGAAACCAATTATCTGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  AACTGGCTATTTTTGAGAAATGGAAGGAATACAGAGGTCAGACACCAGCACAAGCAGAAACCAATTACCTGAAT  666

Query  667  AAAGCCAAATGGCTAGAAATGTATGGGGTTGATATGCATGTGGTCAAGGCTAGAGATGGGAATGACTATAGTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGCCAAATGGCTAGAAATGTATGGTGTTGATATGCACGTGGTCAAGGCTAGAGATGGCAATGACTATAGTTT  740

Query  741  GGGACTAACACCAACAGGAGTCCTTGTTTTTGAAGGAGATACCAAAATTGGCTTATTTTTTTGGCCGAAGATAA  814
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  GGGACTGACTCCAACAGGAGTCCTTGTTTTTGAAGGAGAGACCAAAATTGGCTTGTTTTTCTGGCCCAAGATAA  814

Query  815  CCAGATTGGATTTTAAGAAGAATAAATTAACCTTGGTGGTTGTAGAAGATGATGATCAGGGCAAAGAACAGGAA  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  815  CCAGATTGGATTTTAAGAAGAATAAGTTAACTCTAGTGGTTGTGGAAGATGATGATCAGGGCAAAGAACAAGAG  888

Query  889  CATACATTTGTCTTTAGACTGGATCATCCAAAAGCATGCAAACATTTATGGAAATGTGCTGTGGAGCATCATGC  962
            |||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  CATACCTTTGTCTTTAGATTGGATCACCCTAAAGCCTGCAAACACTTATGGAAATGTGCTGTGGAGCACCATGC  962

Query  963  TTTCTTCCGCCTTCGAGGCCCCGTCCAAAAGAGTTCTCATCGATCAGGATTTATTCGACTAGGATCACGATTTA  1036
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  CTTCTTCCGCCTCCGAGGACCTGTCCAAAAGAGTTCCCATCGATCAGGATTCATTCGACTAGGATCCCGATTTA  1036

Query 1037  GATATAGTGGGAAAACAGAGTATCAGACCACAAAAACCAATAAAGCAAGAAGATCAACATCCTTTGAAAGAAGG  1110
            ||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GATACAGTGGAAAAACAGAATATCAGACCACAAAAACTAATAAAGCAAGAAGATCAACCTCCTTTGAAAGAAGG  1110

Query 1111  CCCAGCAAACGATATTCTAGACGAACTCTACAAATGAAAGCATGTGCTACAAAACCTGAAGAACTTAGTGTTCA  1184
            ||.|||||.||.|||||..||||.||.||.|||||||||||..|..|.|||.||||||||||.|||.|||||| 
Sbjct 1111  CCTAGCAAGCGGTATTCCCGACGGACGCTGCAAATGAAAGCCAGCACAACACAACCTGAAGATCTTGGTGTTC-  1183

Query 1185  CAATAATGTTTCGACCCAAAGTAATGGCTCCCAACAGGCTTGGGGGATGAGATCTGCTCTGCCTGTGAGTCCTT  1258
              .|||||.|||..|.||.|..|.||.||||||||||||||||||..|||..|||.||.|||||||.|.|.|||
Sbjct 1184  --TTAATGCTTCCGCTCAGAAAAGTGACTCCCAACAGGCTTGGGGTGTGATGTCTCCTGTGCCTGTCACTTCTT  1255

Query 1259  CCATTTCCTCTGCTCCTGTGCCAGTGGAGATAGAGAATCTTCCACAGAGTCCTGGAACAGACCAGCATGACAGG  1332
            ||...||||.||...||||||..|||||||||||||||||.|||||||...|||..|||||.|||||.||||||
Sbjct 1256  CCTCATCCTGTGGCGCTGTGCAGGTGGAGATAGAGAATCTCCCACAGACCTCTGCGACAGAGCAGCACGACAGG  1329

Query 1333  AAATGGCTCTCTGCTGCCAGCGACTGCTGTCAACGTGGTGGAAACCAGTGGAACACAAGGGCCTTGCCCCCACC  1406
            |||||||||||||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1330  AAATGGCTCTCTGCTACCAGTGACCGCTGCCAACGTGGTGGAAACCAGTGGAACCCAAGGGCCTTGCCCCCACC  1403

Query 1407  CCAGACCGCACATAGAAACTACACTGACTTTGTTCATGAGCACAATGTGAAGAATGCAGGAATCCGTCATGATG  1480
            ||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||..||.||||||.|
Sbjct 1404  CCAGACTGCATATAGAAACTACACTGACTTTGTACATGAGCATAATGTGAAGAATGCAGGAGCCCATCATGACG  1477

Query 1481  TTCATTTTCCTGGCCATACAGCCATGACTGAGATA  1515
            .|||.||..||||||.|.||||||||||.||||||
Sbjct 1478  CTCAGTTATCTGGCCGTGCAGCCATGACCGAGATA  1512