Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03839
• Subject: NM_001304363.2
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1323
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTGAAAGATCAGATCTCCTTCACTTCAAGTTTGAAAATTATGGAGATTCAATGTTACAAAAAATGAACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGAAAGATCAGATCTCCTTCACTTCAAGTTTGAAAATTATGGAGATTCAATGTTACAAAAAATGAACAA  74

Query   75  ATTAAGAGAAGAGAATAAATTTTGTGATGTTACAGTTCTCATAGATGATATTGAGGTACAGGGACATAAAATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTAAGAGAAGAGAATAAATTTTGTGATGTTACAGTTCTCATAGATGATATTGAGGTACAGGGACATAAAATTG  148

Query  149  TGTTTGCTGCAGGTTCCCCCTTCTTAAGAGACCAATTTTTACTGAATGATTCCAGAGAGGTGAAAATCTCCATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTTTGCTGCAGGTTCCCCCTTCTTAAGAGACCAATTTTTACTGAATGATTCCAGAGAGGTGAAAATCTCCATA  222

Query  223  TTACAGAGTTCCGAAGTGGGGAGACAATTGCTCTTATCCTGTTATAGTGGTGTGCTGGAATTCCCTGAGATGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACAGAGTTCCGAAGTGGGGAGACAATTGCTCTTATCCTGTTATAGTGGTGTGCTGGAATTCCCTGAGATGGA  296

Query  297  ACTGGTAAATTACTTGACTGCTGCAAGTTTTCTTCAGATGAGCCACATTGTAGAACGGTGCACACAGGCCCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGGTAAATTACTTGACTGCTGCAAGTTTTCTTCAGATGAGCCACATTGTAGAACGGTGCACACAGGCCCTGT  370

Query  371  GGAAGTTTATAAAGCCAAAACAACCAATGGATAGTAAAGAGGGATGTGAACCACAGAGTGCTTCTCCCCAGTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAAGTTTATAAAGCCAAAACAACCAATGGATAGTAAAGAGGGATGTGAACCACAGAGTGCTTCTCCCCAGTCA  444

Query  445  AAAGAACAGCAGGGAGATGCCAGAGGCTCCCCAAAGCAGGACTCACCTTGTATTCATCCATCTGAAGACAGTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGAACAGCAGGGAGATGCCAGAGGCTCCCCAAAGCAGGACTCACCTTGTATTCATCCATCTGAAGACAGTAT  518

Query  519  GGATATGGAGGACAGTGATATTCAGATTGTTAAGGTAGAATCTATTGGGGATGTATCAGAGGTTAGAAGTAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATATGGAGGACAGTGATATTCAGATTGTTAAGGTAGAATCTATTGGGGATGTATCAGAGGTTAGAAGTAAAA  592

Query  593  AAGATCAGAACCAGTTTATTTCTTCTGAACCCACTGCTTTACATTCATCAGAGCCCCAGCACTCCCTGATAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGATCAGAACCAGTTTATTTCTTCTGAACCCACTGCTTTACATTCATCAGAGCCCCAGCACTCCCTGATAAAT  666

Query  667  TCAACTGTGGAAAACAGAGTAAGTGAAATAGAACAAAACCATCTCCACAATTATGCCCTTTCTTATACAGGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAACTGTGGAAAACAGAGTAAGTGAAATAGAACAAAACCATCTCCACAATTATGCCCTTTCTTATACAGGCAG  740

Query  741  TGATAACATCATCATGGCCTCAAAAGATGTCTTTGGCCCTAATATTCGAGGTGTAGACAAAGGCCTACAGTGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATAACATCATCATGGCCTCAAAAGATGTCTTTGGCCCTAATATTCGAGGTGTAGACAAAGGCCTACAGTGGC  814

Query  815  ATCACCAGTGCCCAAAGTGTACCAGGGTGTTTCGTCACCTGGAGAACTACGCCAACCATTTAAAAATGCACAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCACCAGTGCCCAAAGTGTACCAGGGTGTTTCGTCACCTGGAGAACTACGCCAACCATTTAAAAATGCACAAA  888

Query  889  CTCTTTATGTGTCTACTCTGCGGCAAGACTTTCACTCAGAAAGGCAACCTTCATCGACACATGCGTGTGCATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCTTTATGTGTCTACTCTGCGGCAAGACTTTCACTCAGAAAGGCAACCTTCATCGACACATGCGTGTGCATGC  962

Query  963  CGGAATTAAACCTTTCCAGTGTAAAATCTGTGGGAAAACCTTTTCTCAGAAGTGTTCCTTACAGGATCATCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGAATTAAACCTTTCCAGTGTAAAATCTGTGGGAAAACCTTTTCTCAGAAGTGTTCCTTACAGGATCATCTTA  1036

Query 1037  ACCTTCACAGTGGAGATAAGCCCCATAAATGTAACTATTGTGATATGGTTTTTGCACATAAACCAGTTTTGAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTTCACAGTGGAGATAAGCCCCATAAATGTAACTATTGTGATATGGTTTTTGCACATAAACCAGTTTTGAGG  1110

Query 1111  AAACACCTTAAACAGCTGCATGGCAAAAACAGCTTTGATAATGCCAATGAGAGAAATGTACAAGACCTCACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACACCTTAAACAGCTGCATGGCAAAAACAGCTTTGATAATGCCAATGAGAGAAATGTACAAGACCTCACAGT  1184

Query 1185  GGATTTTGATTCTTTTGCATGTACAACAGTCACAGACTCTAAAGGGTGTCAGCCACAACCCGATGCAACACAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATTTTGATTCTTTTGCATGTACAACAGTCACAGACTCTAAAGGGTGTCAGCCACAACCCGATGCAACACAGG  1258

Query 1259  TCCTGGATGCAGGTAAACTGGCCCAAGCTGTCCTGAACTTAAGAAATGATAGTACTTGTGTGAAT  1323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCTGGATGCAGGTAAACTGGCCCAAGCTGTCCTGAACTTAAGAAATGATAGTACTTGTGTGAAT  1323