Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03839
• Subject: NM_199025.3
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1262
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTCTGAAAGATCAGATCTCCTTCACTTCAAGTTTGAAAATTATGGAGATTCAATGTTACAAAAAATGAACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGAAAGATCAGATCTCCTTCACTTCAAGTTTGAAAATTATGGAGATTCAATGTTACAAAAAATGAACAA  74

Query   75  ATTAAGAGAAGAGAATAAATTTTGTGATGTTACAGTTCTCATAGATGATATTGAGGTACAGGGACATAAAATTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  ATTAAGAGAAGAGAATAAATTTTGTGATGTTACAGTTCTCATAGATGATGTTGAGGTGCAGGGGCATAAAATTG  148

Query  149  TGTTTGCTGCAGGTTCCCCCTTCTTAAGAGACCAATTTTTACTGAATGATTCCAGAGAGGTGAAAATCTCCATA  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTTGCTGCAGGTTCCCCCTTCTTAAGAGACCAGTTTTTACTGAATGATTCCCGAGAGGTGAAAATCTCCATA  222

Query  223  TTACAGAGTTCCGAAGTGGGGAGACAATTGCTCTTATCCTGTTATAGTGGTGTGCTGGAATTCCCTGAGATGGA  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACAGAGTTCTGAAGTGGGGAGACAATTGCTCTTGTCCTGTTATAGTGGTGTGCTGGAATTCCCTGAGATGGA  296

Query  297  ACTGGTAAATTACTTGACTGCTGCAAGTTTTCTTCAGATGAGCCACATTGTAGAACGGTGCACACAGGCCCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  ACTGGTAAATTACTTGACTGCTGCGAGTTTTCTTCAGATGAGCCACATTGTAGAACGGTGCACACAGGCGCTGT  370

Query  371  GGAAGTTTATAAAGCCAAAACAACCAATGGATAGTAAAGAGGGATGTGAACCACAGAGTGCTTCTCCCCAGTCA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  371  GGAAGTTTATAAAGCCAAAACAACCAATGGATAGTAAAGAGGGATCTGAACCACAGAGCGCTTCTCCCCAGTCG  444

Query  445  AAAGAACAGCAGGGAGATGCCAGAGGCTCCCCAAAGCAGGACTCACCTTGTATTCATCCATCTGAAGACAGTAT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGAACAGCAGGGAGATGCCAGAGGCTCTCCAAAGCAGGACTTACCTTGTATTCATCCATCTGAAGACAGTAT  518

Query  519  GGATATGGAGGACAGTGATATTCAGATTGTTAAGGTAGAATCTATTGGGGATGTATCAGAGGTTAGAAGTAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  GGATATGGAGGACAGTGATATTCAGATTGTTAAGGTAGAATCTATTGGGGATGTATCAGAGGATAGAAGTAAAA  592

Query  593  AAGATCAGAACCAGTTTATTTCTTCTGAACCCACTGCTTTACATTCATCAGAGCCCCAGCACTCCCTGATAAAT  666
            |||||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  AAGATGAGAACCAGTACATTTCTTCTGAACCCACTGCTTTGCACTCATCAGAGCCCCAGCACTCCCTGATAAAC  666

Query  667  TCAACTGTGGAAAACAGAGTAAGTGAAATAGAACAAAACCATCTCCACAATTATGCCCTTTCTTATACAGGCAG  740
            ||||||||||||||||||||.|.||||.||||.||.|.|||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.
Sbjct  667  TCAACTGTGGAAAACAGAGTTAATGAACTAGACCAGAGCCATCTCCACAATTACGCCCTCTCTTACACAGGCAA  740

Query  741  TGATAACATCATCATGGCCTCAAAAGATGTCTTTGGCCCTAATATTCGAGGTGTAGACAAAGGCCTACAGTGGC  814
            ||||.|||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  TGATGACATCATCATGACCTCTAAAGATGTCTTTGGGCCTAATATTCGAGGTGTAGACAAAGGCTTACAGTGGC  814

Query  815  ATCACCAGTGCCCAAAGTGTACCAGGGTGTTTCGTCACCTGGAGAACTACGCCAACCATTTAAAAATGCACAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCACCAGTGCCCAAAGTGTACCAGGGTATTCCGTCACCTGGAGAACTACGCCAACCATTTAAAAATGCACAAA  888

Query  889  CTCTTTATGTGTCTACTCTGCGGCAAGACTTTCACTCAGAAAGGCAACCTTCATCGACACATGCGTGTGCATGC  962
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  CTGTTTATGTGTCTACTCTGCGGCAAGACTTTCACTCAGAAAGGCAATCTTCATCGACACATGCGTGTACATGC  962

Query  963  CGGAATTAAACCTTTCCAGTGTAAAATCTGTGGGAAAACCTTTTCTCAGAAGTGTTCCTTACAGGATCATCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  CGGAATTAAACCTTTCCAGTGTAAAATCTGTGGGAAAACCTTTTCTCAGAAGTGTTCCTTACAGGACCATCTTA  1036

Query 1037  ACCTTCACAGTGGAGATAAGCCCCATAAATGTAACTATTGTGATATGGTTTTTGCACATAAACCAGTTTTGAGG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTTCACAGTGGAGATAAGCCCCATAAATGTAACTATTGTGACATGGTTTTTGCACATAAGCCAGTTTTGAGG  1110

Query 1111  AAACACCTTAAACAGCTGCATGGCAAAAACAGCTTTGATAATGCCAATGAGAGAAATGTACAAGACCTCACAGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACACCTTAAACAGCTGCATGGCAAAAACAGCTTTGATAATGCCAATGAGAGGAGTGTACAAGACCTCACAGT  1184

Query 1185  GGATTTTGATTCTTTTGCATGTACAACAGTCACAGACTCTAAAGGGTGTCAGCCACAACCCGATGCAACACAGG  1258
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||   .||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  GGATTTTGACTCTTTTGCATGTACAACAGTCACAGACTCTAA---TTGCCAGCCACAACCTGATGCAACACAGG  1255

Query 1259  TCCTGGATGCAGGTAAACTGGCCCAAGCTGTCCTGAACTTAAGAAATGATAGTACTTGTGTGAAT  1323
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.||||||.|.|||.|||||.|||||||||
Sbjct 1256  TCCTGGATGCAGGTAAACTGACCCAAGCTGTCCTCAGCTTAAGGAGTGACAGTACATGTGTGAAT  1320