Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03845
• Subject: NM_001146111.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1110
• Gaps: 300

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTATGTTTAATTGGTTTACAGACTGTCTGTGGACTCTTTTCCTGTCAAATTACCAGCCATCTGTTGAATC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCAAGTCCAGGAGGTTCAGCAACATCAGATGACCATGAATTTGATCCATCAGCTGACATGCTGGTTCATGATT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTGATGATGAACGAACATTAGAAGAGGAAGAAATGATGGAAGGAGAAACAAACTTCAGCTCTGAAATAGAAGAT  222

Query    1  ------------------ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACC  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGCAAGGGAAGGCGACATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACC  296

Query   57  TGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACA  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACA  370

Query  131  GTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCC  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCC  444

Query  205  AATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTT  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTT  518

Query  279  TGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGG  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGG  592

Query  353  AGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTA  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTA  666

Query  427  TATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGA  740

Query  501  TGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAAC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAAC  814

Query  575  AGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAA  888

Query  649  GCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGG  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGG  962

Query  723  AAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACA  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACA  1036

Query  797  TGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCAT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCAT  1110

Query  871  CCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCC  1184

Query  945  TCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAA  1258

Query 1019  ATGGAGTGTCATCTAATGGAC-----------------------------------------------------  1039
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 1259  ATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAAAAGTTGAAGGGTTACACATTAAT  1332

Query 1040  -------CAGGCATACTCCAAATGCTTCTTCCAGTTCATTTTTCAGCCATCAGTTCAAGAGCCAATGCCTTTTT  1106
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGACCAACAGGCATACTCCAAATGCTTCTTCCAGTTCATTTTTCAGCCATCAGTTCAAGAGCCAATGCCTTTTT  1406

Query 1107  AAAA  1110
            ||||
Sbjct 1407  AAAA  1410