Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03845
• Subject: XM_017001927.1
• Aligned Length: 1535
• Identities: 1094
• Gaps: 427

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGCCATCTGTTGAATCTTCAAGTCCAGGAGGTTCAGCAACATCAGATGACCATGAATTTGATCCATCAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGACATGCTGGTTCATGATTTTGATGATGAACGAACATTAGAAGAGGAAGAAATGATGGAAGGAGAAACAAACT  148

Query    1  --------------------------------------ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTAT  36
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTCTGAAATAGAAGATCTTGCAAGGGAAGGCGACATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTAT  222

Query   37  GGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGA  110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGA  296

Query  111  TGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGG  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGG  370

Query  185  AGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGC  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGC  444

Query  259  CCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCC  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCC  518

Query  333  ATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGAT  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGAT  592

Query  407  ACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAA  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAA  666

Query  481  GTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATC  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATC  740

Query  555  TCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAA  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAA  814

Query  629  GATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAA  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAA  888

Query  703  CAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGA  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGA  962

Query  777  ATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAA  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAA  1036

Query  851  AGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCA  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCA  1110

Query  925  TCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCAC  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCAC  1184

Query  999  TGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGG------------CA---------------  1045
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||               
Sbjct 1185  TGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAAAAG  1258

Query 1046  ---------TACTCCA--AATG--------------------------CTTCTTCCAGTTCAT-----------  1071
                     ||| .||  ||||                          ||||.|.|||.| ||           
Sbjct 1259  TTGAAGGGTTAC-ACATTAATGGACCAACAGGTGGAAATAAGAAACCACTTCATGCAGAT-ATGGATACTAATG  1330

Query 1072  -TTTTCA-------------------------------GCC---ATCAGTTCAAGA---GCCAATGCCTTT--T  1105
             ||.|.|                               |||   ||.|.|.|||||   |..||||..|||  |
Sbjct 1331  GTTATGAAACAGATAACCTTACCACTGACCCAAAACTTGCCCATATGACTGCAAGAAATGAAAATGATTTTGAT  1404

Query 1106  TAAAA---------------------------------------------------------------------  1110
            .||||                                                                     
Sbjct 1405  GAAAAAAGTGAGAGACCTGCCAAAAGGCGAAGGGTAAACAGCAATGGAAAAGAAAGTCCAGGTTCTTCTGAATT  1478

Query 1111  -------------------------------------------------------  1110
                                                                   
Sbjct 1479  TTTCCAAGAAGCAGTCTCACATGGGAAATTTGAAGAACTTGAAAACACAGATGAC  1533