Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03845
• Subject: XM_017001931.1
• Aligned Length: 1457
• Identities: 1094
• Gaps: 349

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGGTTCATGATTTTGATGATGAACGAACATTAGAAGAGGAAGAAATGATGGAAGGAGAAACAAACTTCAG  74

Query    1  ----------------------------------ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTA  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGAAATAGAAGATCTTGCAAGGGAAGGCGACATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTA  148

Query   41  GTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCT  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCT  222

Query  115  GATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGA  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAAATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGA  296

Query  189  TGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCAC  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAATCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCAC  370

Query  263  GTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCA  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGTAGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCA  444

Query  337  GAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAA  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCATGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAA  518

Query  411  AGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGA  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAGCTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGA  592

Query  485  TTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGGTGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCAC  666

Query  559  ATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGGTTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATT  740

Query  633  AAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTATCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAG  814

Query  707  GGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGATTCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGT  888

Query  781  GTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAA  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAACGTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAA  962

Query  855  GAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTACATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTA  1036

Query  929  GTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTA  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAACAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTA  1110

Query 1003  AGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGG------------CA-------------------  1045
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||                   
Sbjct 1111  AGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATGGACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAAAAGTTGA  1184

Query 1046  -----TACTCCA--AATG--------------------------CTTCTTCCAGTTCAT------------TTT  1074
                 ||| .||  ||||                          ||||.|.|||.| ||            ||.
Sbjct 1185  AGGGTTAC-ACATTAATGGACCAACAGGTGGAAATAAGAAACCACTTCATGCAGAT-ATGGATACTAATGGTTA  1256

Query 1075  TCA-------------------------------GCC---ATCAGTTCAAGA---GCCAATGCCTTT--TTAAA  1109
            |.|                               |||   ||.|.|.|||||   |..||||..|||  |.|||
Sbjct 1257  TGAAACAGATAACCTTACCACTGACCCAAAACTTGCCCATATGACTGCAAGAAATGAAAATGATTTTGATGAAA  1330

Query 1110  A-------------------------------------------------------------------------  1110
            |                                                                         
Sbjct 1331  AAAGTGAGAGACCTGCCAAAAGGCGAAGGGTAAACAGCAATGGAAAAGAAAGTCCAGGTTCTTCTGAATTTTTC  1404

Query 1111  ---------------------------------------------------  1110
                                                               
Sbjct 1405  CAAGAAGCAGTCTCACATGGGAAATTTGAAGAACTTGAAAACACAGATGAC  1455