Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03845
• Subject: XM_017001933.1
• Aligned Length: 1349
• Identities: 1094
• Gaps: 241

Alignment

Query    1  ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGA  74

Query   75  GGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAA  148

Query  149  ATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAA  222

Query  223  TCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGT  296

Query  297  AGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCA  370

Query  371  TGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAG  444

Query  445  CTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGG  518

Query  519  TGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGG  592

Query  593  TTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTA  666

Query  667  TCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGAT  740

Query  741  TCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAAC  814

Query  815  GTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTAC  888

Query  889  ATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAA  962

Query  963  CAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATG  1036

Query 1037  GACCAGG------------CA------------------------TACTCCA--AATG----------------  1056
            |||||||            ||                        ||| .||  ||||                
Sbjct 1037  GACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAAAAGTTGAAGGGTTAC-ACATTAATGGACCAACAGGTGGAAA  1109

Query 1057  ----------CTTCTTCCAGTTCAT------------TTTTCA-------------------------------  1077
                      ||||.|.|||.| ||            ||.|.|                               
Sbjct 1110  TAAGAAACCACTTCATGCAGAT-ATGGATACTAATGGTTATGAAACAGATAACCTTACCACTGACCCAAAACTT  1182

Query 1078  GCC---ATCAGTTCAAGA---GCCAATGCCTTT--TTAAAA---------------------------------  1110
            |||   ||.|.|.|||||   |..||||..|||  |.||||                                 
Sbjct 1183  GCCCATATGACTGCAAGAAATGAAAATGATTTTGATGAAAAAAGTGAGAGACCTGCCAAAAGGCGAAGGGTAAA  1256

Query 1111  --------------------------------------------------------------------------  1110
                                                                                      
Sbjct 1257  CAGCAATGGAAAAGAAAGTCCAGGTTCTTCTGAATTTTTCCAAGAAGCAGTCTCACATGGGAAATTTGAAGAAC  1330

Query 1111  -----------------  1110
                             
Sbjct 1331  TTGAAAACACAGATGAC  1347