Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03845
- Subject:
- XM_017001934.1
- Aligned Length:
- 1349
- Identities:
- 1094
- Gaps:
- 241
Alignment
Query 1 ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCAATTCATGAACTTCTCAGCCTTTATGGTTATGGTAGTACTGTTCGACTACCTGAAGAAGATGAGGAAGA 74
Query 75 GGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGAAGATGATGAAGATGCTGATAATGATGACAACAGTGGCTGTAGTGGGGAAA 148
Query 149 ATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATAAAGAGGAGAATATAAAGGATTCATCAGGTCAGGAGGATGAAACTCAGTCTTCCAATGATGATCCATCACAA 222
Query 223 TCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGTTGCTTCTCAAGATGCCCAGGAAATAATCCGCCCACGTCGATGTAAATATTTTGATACAAATAGTGAAGT 296
Query 297 AGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAAGAAGAATCTGAAGAAGATGAAGATTATATTCCATCAGAAGACTGGAAAAAGGAGATTATGGTGGGCTCCA 370
Query 371 TGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTTTCAAGCAGAAATTCCAGTTGGCATTTGTAGATACAAAGAAAATGAAAAAGTATATGAAAATGATGATCAG 444
Query 445 CTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTCCTGTGGGACCCTGAGTACTTACCAGAAGATAAAGTGATTATATTTCTTAAAGATGCATCTAGAAGAACAGG 518
Query 519 TGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGATGAGAAGGGTGTAGAAGCAATTCCTGAAGGATCTCACATAAAAGACAATGAACAGGCTTTATATGAATTGG 592
Query 593 TTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTAAATGCAATTTTGATACAGAAGAAGCATTGAGAAGATTAAGATTTAATGTAAAAGCAGCTAGAGAGGAATTA 666
Query 667 TCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGTTTGGACAGAGGAAGAGTGTAGAAATTTTGAACAAGGGCTGAAGGCCTATGGAAAGGATTTTCATTTGAT 740
Query 741 TCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCAGGCTAATAAAGTCCGAACAAGGTCAGTTGGTGAATGTGTAGCATTCTATTACATGTGGAAAAAATCTGAAC 814
Query 815 GTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTATGATTTCTTTGCTCAGCAAACACGATTTGGAAAGAAGAAATATAATCTTCATCCTGGTGTAACGGATTAC 888
Query 889 ATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGGATCGTCTTCTAGACGAAAGTGAAAGTGCTGCATCTAGTCGAGCACCATCCCCTCCCCCAACTGCATCAAA 962
Query 963 CAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTAGTAACAGCCAGTCTGAGAAAGAAGATGGCACTGTAAGCACTGCTAATCAAAATGGAGTGTCATCTAATG 1036
Query 1037 GACCAGG------------CA------------------------TACTCCA--AATG---------------- 1056
||||||| || ||| .|| ||||
Sbjct 1037 GACCAGGTGAAATATTAAACAAAGAGGAAGTAAAAGTTGAAGGGTTAC-ACATTAATGGACCAACAGGTGGAAA 1109
Query 1057 ----------CTTCTTCCAGTTCAT------------TTTTCA------------------------------- 1077
||||.|.|||.| || ||.|.|
Sbjct 1110 TAAGAAACCACTTCATGCAGAT-ATGGATACTAATGGTTATGAAACAGATAACCTTACCACTGACCCAAAACTT 1182
Query 1078 GCC---ATCAGTTCAAGA---GCCAATGCCTTT--TTAAAA--------------------------------- 1110
||| ||.|.|.||||| |..||||..||| |.||||
Sbjct 1183 GCCCATATGACTGCAAGAAATGAAAATGATTTTGATGAAAAAAGTGAGAGACCTGCCAAAAGGCGAAGGGTAAA 1256
Query 1111 -------------------------------------------------------------------------- 1110
Sbjct 1257 CAGCAATGGAAAAGAAAGTCCAGGTTCTTCTGAATTTTTCCAAGAAGCAGTCTCACATGGGAAATTTGAAGAAC 1330
Query 1111 ----------------- 1110
Sbjct 1331 TTGAAAACACAGATGAC 1347