Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03848
• Subject: NM_201638.2
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1248
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATAGCCGCTTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGACAGCTCCTCGCGCAGCAGTTGGGAGC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATAGCCGCCTGCAGGAGATCCGGGAGCGGCAGAAGTTACGGCGGCAGCTCCTAGCTCAGCAGTTGGGAGC  74

Query   75  TGAAAGTGCCGACAGCATTGGTGCCGTGTTAAATAGCAAAGATGAGCAGAGAGAAATTGCTGAAACAAGAGAAA  148
            |||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  TGAGAGTGCGGATAGCATTGGTGCTGTGTTAAATAGCAAAGATGAACAGAGGGAGATTGCTGAAACCAGAGAAA  148

Query  149  CTTGCAGGGCTTCCTATGATACCTCTGCTCCAAATGCAAAACGTAAGTATCTGGATGAAGGAGAGACAGATGAA  222
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CCTGCAGGGCTTCCTATGATACATCTGCTCCAAACTCAAAACGGAAGTGTCTGGATGAAGGAGAGACTGATGAA  222

Query  223  GACAAAATGGAAGAATATAAGGATGAACTAGAAATGCAACAGGATGAAGAAAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT  296
            ||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAAAGTAGAAGAATATAAGGATGAACTGGAAATGCAGCAGGAGGAAGAGAATTTGCCATATGAAGAAGAGAT  296

Query  297  TTACAAAGATTCTAGTACTTTTCTTAAGGGAACACAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACAAAGATTCCAGTACCTTTCTTAAGGGAACGCAGAGCTTAAATCCCCATAATGATTACTGCCAACATTTTG  370

Query  371  TAGACACTGGACATAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATATCCTAAA  444
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  TAGACACTGGACACAGACCTCAGAATTTCATCAGGGATGTAGGTTTAGCTGACAGATTTGAAGAATACCCTAAA  444

Query  445  CTGAGGGAGCTCATCAGGCTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAATCTAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCCGA  518
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CTTAGGGAACTCATCAGACTAAAGGATGAGTTAATAGCTAAGTCAAACACTCCTCCCATGTACTTACAAGCAGA  518

Query  519  TATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAACTAACACCCAAATTTGATGTGATTCTTCTGGAACCCCCTTTAGAAGAAT  592
            .||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||
Sbjct  519  CATAGAAGCCTTTGACATCAGAGAATTGACACCCAAATTTGATGTGATTCTCCTGGAGCCCCCTCTGGAAGAAT  592

Query  593  ATTACAGAGAAACTGGCATCACTGCTAATGAAAAATGCTGGACTTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATTGAT  666
            |.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  ACTATAGAGAGACTGGCATCACTGCGAATGAGAAATGCTGGACCTGGGATGATATTATGAAGTTAGAAATCGAT  666

Query  667  GAGATTGCAGCACCTCGATCATTTATTTTTCTCTGGTGTGGTTCTGGGGAGGGGTTGGACCTTGGAAGAGTGTG  740
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  GAGATTGCAGCACCTCGGTCATTTATATTTCTCTGGTGCGGTTCTGGGGAAGGATTGGACCTTGGGAGAGTATG  740

Query  741  TTTACGAAAATGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGGAAGA  814
            .||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CTTGCGAAAGTGGGGTTACAGAAGATGTGAAGATATTTGTTGGATTAAAACCAATAAAAACAATCCTGGAAAGA  814

Query  815  CTAAGACTTTAGATCCAAAGGCTGTCTTTCAGAGAACAAAGGAACACTGCCTCATGGGGATCAAAGGAACTGTG  888
            |.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CAAAGACTCTAGATCCAAAGGCAGTTTTCCAGAGAACAAAGGAGCATTGCCTGATGGGGATCAAAGGAACCGTG  888

Query  889  AAGCGTAGCACAGACGGGGACTTCATTCATGCTAATGTTGACATTGACTTAATTATCACAGAAGAACCTGAAAT  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AAGCGAAGCACAGACGGGGACTTCATTCATGCTAATGTTGACATTGACTTAATTATCACAGAAGAACCTGAGAT  962

Query  963  TGGCAATATAGAAAAACCTGTAGAAATTTTTCATATAATTGAGCATTTTTGTCTTGGTAGAAGACGCCTTCATC  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCAATATAGAAAAACCAGTAGAAATTTTTCATATAATAGAACATTTTTGTCTTGGTAGAAGACGCCTTCATC  1036

Query 1037  TATTTGGAAGAGATAGTACAATTCGACCAGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAATAGCAACTACAAT  1110
            |.|||||.||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1037  TCTTTGGGAGAGATAGCACTATCAGGCCAGGCTGGCTCACAGTTGGACCAACGCTTACAAACAGTAACTACAAT  1110

Query 1111  GCAGAAACATATGCATCCTATTTCAGTGCTCCTAATTCCTACTTGACTGGTTGTACAGAAGAAATTGAGAGACT  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1111  GCAGAAACATATGCATCGTATTTCAGTGCCCCCAACTCATACTTGACCGGATGTACAGAGGAAATCGAGAGGCT  1184

Query 1185  TCGACCAAAATCGCCTCCTCCCAAATCTAAATCTGACCGAGGAGGTGGAGCTCCCAGAGGTGGAGGAAGAGGTG  1258
            ||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  TCGACCGAAGTCACCTCCTCCCAAGTCCAAGTCTGACCGTGGGGGTGGAGCTCCCAGAGGTGGAGGAAGGGGGG  1258

Query 1259  GAACTTCTGCTGGCCGTGGACGAGAAAGAAATAGATCTAACTTCCGAGGAGAAAGAGGTGGCTTTAGAGGGGGC  1332
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||..||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  GAACATCTGCTGGCCGTGGTCGGGAAAGAAACCGATCCAATTTCCGAGGAGAGAGAGGTGGCTTTAGGGGGGGC  1332

Query 1333  CGTGGAGGAGCACACAGAGGTGGCTTTCCACCTCGA  1368
            ||||||||..|.||||||||.||||||.|.|||||.
Sbjct 1333  CGTGGAGGCACGCACAGAGGCGGCTTTACTCCTCGG  1368